结论：员工因缺少打卡记录被扣工资，是否合理需分情况讨论，不能一概而论。以下是具体分析：

1. 公司规章制度合法且已告知员工
   若公司有明确的考勤制度（如规定“未打卡视为旷工，旷工一天扣当日工资”），且该制度已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论）、未违反法律强制性规定（如最低工资标准、加班费支付等），并已向员工公示或送达（如培训签到、邮件通知、员工手册签字确认），则公司有权依据制度扣减工资。
   但需注意：扣减金额需合理，例如不能因一次未打卡扣减超过当日工资，或以“未打卡”为由变相克扣其他福利。若制度中未明确扣减标准，公司可能因“未依法制定规章制度”被认定违法。

2. 公司规章制度不合法或未告知员工
   若公司无合法有效的考勤制度，或制度未向员工公示（如未签字确认、未通过内部系统通知），则公司无权以“未打卡”为由扣减工资。此时员工可主张公司补发工资，并可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
   法律依据：根据《劳动合同法》第4条，用人单位的规章制度需经民主程序制定、不违反法律且向劳动者公示，否则对劳动者不生效。

3. 员工能证明实际出勤
   若员工虽未打卡，但能提供其他证据证明实际出勤（如同事证言、工作记录、客户沟通记录、门禁系统记录等），则公司扣减工资缺乏事实依据，员工可要求补发工资。
   建议：员工平时可保留工作证据（如邮件、微信记录、签到表照片等），以备维权时使用。

4. 公司以“未打卡”为由变相辞退或调岗
   若公司以“未打卡”为由认定员工“严重违反规章制度”并辞退，或强制调岗、降薪，需满足“制度合法+员工多次违规+扣减合理”等条件。否则可能构成违法解除劳动合同，员工可主张赔偿金（2N）或继续履行合同。

行动建议：

• 第一步：检查公司考勤制度是否合法（是否经民主程序、是否公示、是否违反法律）；
  
• 第二步：收集能证明实际出勤的证据（如工作记录、同事证言等）；
  
• 第三步：与公司协商补发工资，若协商无果可向劳动监察部门投诉（12333）或申请劳动仲裁（需在1年内提出）。
  

如有进一步疑问（如制度合法性判断、证据收集技巧等），可直接向我咨询，我会结合具体细节为您详细分析。