怀孕休假期间，绩效是否会被扣除，这主要取决于公司的具体规章制度以及劳动合同中的相关约定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 公司规章制度与劳动合同：

   • 规章制度：许多公司会在其规章制度中明确规定员工在休假期间的薪酬和绩效处理方式。如果公司的规章制度中明确指出怀孕休假期间不扣除绩效，那么员工就有权享受全额绩效。
   • 劳动合同：劳动合同是员工与公司之间约定权利和义务的法律文件。如果劳动合同中明确规定了怀孕休假期间的绩效处理方式，那么双方应严格按照合同执行。

2. 法律法规：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国妇女权益保障法》的相关规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内的，用人单位不得降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。虽然这些法律条款并未直接提及绩效扣除问题，但它们为女职工在特殊时期的权益保护提供了法律基础。
   • 如果公司规章制度或劳动合同中的规定与法律法规相抵触，那么这些规定将被视为无效，公司应按照法律法规的规定执行。

3. 实际操作与建议：

   • 了解公司政策：员工在怀孕休假前，应详细了解公司的规章制度和劳动合同中关于休假期间绩效处理的规定。
   • 与公司沟通：如果员工对公司的绩效扣除政策有疑问或不满，应及时与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，寻求合理的解决方案。
   • 保留证据：员工应保留好与公司的沟通记录、规章制度、劳动合同等相关证据，以备不时之需。
   • 寻求法律援助：如果员工认为公司的绩效扣除政策违反了法律法规或劳动合同中的约定，且无法与公司达成一致意见，可以寻求法律援助或向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁。

总结来说，怀孕休假期间绩效是否会被扣除，并没有一个统一的答案。它取决于公司的具体规章制度、劳动合同中的相关约定以及法律法规的规定。因此，员工在怀孕休假前应详细了解相关政策，并在必要时与公司进行沟通或寻求法律援助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。