在行政处罚案件中，不一样的违法事实通常是可以分开立案的，但具体还需根据案件性质、违法事实的关联性以及相关法律法规的规定来综合判断。以下从几个角度进行详细分析：

1. 违法事实的独立性：

   • 如果不同的违法事实之间相互独立，没有直接的关联或影响，那么行政机关通常可以分别对这些违法事实进行立案调查。例如，一个企业同时存在未按规定缴纳税款和未按规定处理工业废物两个违法行为，这两个行为性质不同，且相互独立，行政机关可以分别对其进行立案处罚。

2. 违法事实的关联性：

   • 如果不同的违法事实之间存在关联或相互影响，行政机关在立案时可能需要考虑这种关联性。在某些情况下，为了全面、准确地查明案件事实，行政机关可能会选择将相关联的违法事实合并立案调查。然而，这并不意味着所有关联的违法事实都必须合并立案，行政机关仍有权根据具体情况进行裁量。

3. 法律法规的规定：

   • 行政机关在立案时还需遵循相关法律法规的规定。例如，《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律对行政处罚的立案、调查、处罚等程序都有明确规定。行政机关在立案时，应确保符合这些法律法规的要求，包括但不限于立案的条件、程序、时限等。

4. 行政效率与公正性：

   • 在考虑是否分开立案时，行政机关还需权衡行政效率与公正性。分开立案可能有助于更专注于每个违法事实的调查和处理，提高行政效率；但同时也可能增加行政成本和时间成本。因此，行政机关在决定是否分开立案时，应综合考虑案件的具体情况、行政资源以及社会效果等因素。

建议：

• 对于行政机关而言，在决定是否对不一样的违法事实分开立案时，应仔细审查案件事实、相关法律法规以及行政效率与公正性等因素，确保立案决定的合法性和合理性。
• 对于当事人而言，如果面临多个违法事实的指控，应积极配合行政机关的调查工作，同时有权对立案决定提出异议或申请复议等法律救济途径。

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