针对行政违法既处罚单位又处罚负责人是否需要分别立案的问题，结论是：一般情况下，对单位和直接负责的主管人员或其他直接责任人员的行政处罚，应当分别立案处理。以下从几个方面进行详细分析：

1. 立案的独立性：

   • 行政处罚的立案是针对具体违法行为和违法主体的独立程序。单位和负责人作为两个不同的违法主体，其违法行为虽然可能相关联，但在法律上应视为两个独立的违法行为（或同一违法行为下的不同责任主体）。
   • 因此，对单位和负责人的行政处罚，通常需要分别进行立案调查，以明确各自的违法事实、责任大小和处罚依据。

2. 处罚的依据和程序：

   • 根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规，行政处罚应当遵循法定程序，包括立案、调查、审查、决定和执行等环节。
   • 在对单位和负责人进行处罚时，需要分别收集证据、查明事实、适用法律，并作出相应的处罚决定。这些程序上的要求也支持了分别立案的必要性。

3. 实践中的操作：

   • 在实际执法过程中，行政机关通常会根据违法行为的性质和情节，同时或先后对单位和负责人进行立案调查。
   • 例如，在环境污染案件中，环保部门可能会先对污染企业（单位）进行立案调查，并同时或随后对企业的直接负责的主管人员或其他直接责任人员进行立案调查。
   • 这种分别立案的方式有助于确保处罚的公正性和有效性，避免因为对单位或负责人的处罚不当而引发法律争议。

4. 特殊情况下的处理：

   • 虽然一般情况下需要分别立案，但在某些特殊情况下，如违法行为轻微、事实清楚且责任明确时，行政机关可能会考虑合并立案或简化程序。
   • 然而，这种情况并不常见，且需要严格遵守法律法规的规定和程序要求。

建议：

• 对于行政机关而言，在处理涉及单位和负责人的行政违法案件时，应严格按照法律法规的规定和程序要求进行立案调查，确保处罚的公正性和有效性。
• 对于单位和负责人而言，如果面临行政处罚的立案调查，应积极配合行政机关的工作，提供必要的证据和资料，以维护自身的合法权益。

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