结论：能否起诉“小三”，主要取决于您想要追究其什么责任以及您手头掌握的证据情况。一般来说，如果涉及财产返还或侵权责任，即使老公和小三分开两年，您仍然有可能起诉“小三”；但如果涉及重婚等刑事责任，则可能因时间因素及证据问题而面临较大挑战。以下从不同角度为您详细分析：
一、从民事责任角度分析
财产返还：
- 如果老公在婚姻关系存续期间，未经您同意，将夫妻共同财产赠与给“小三”，您有权要求“小三”返还这些财产。
- 这种情况下，即使老公和“小三”已经分开两年，您仍然可以基于物权法或婚姻法的相关规定，向法院提起诉讼，要求“小三”返还财产。
- 关键点：您需要提供充分的证据证明这些财产是夫妻共同财产，且被老公擅自赠与给了“小三”。
侵权责任：
- 如果“小三”的行为对您的名誉权、隐私权等造成了侵害，您有权要求“小三”承担侵权责任。
- 这种情况下，起诉“小三”并不受时间限制，只要您能证明侵权行为的存在以及损害后果，就可以向法院提起诉讼。
- 关键点：您需要收集并保存好相关证据，如聊天记录、短信、邮件等，以证明“小三”的侵权行为。
二、从刑事责任角度分析
重婚罪：
- 如果“小三”明知您老公有配偶而与之结婚，或者以夫妻名义共同生活，可能构成重婚罪。
- 但是，重婚罪的追究通常受到时间限制，且需要充分的证据证明“小三”与您老公存在持续的、以夫妻名义共同生活的关系。
- 挑战：由于老公和“小三”已经分开两年，可能难以收集到足够的证据来证明他们之前存在重婚行为。
其他刑事责任：
- 除非“小三”的行为涉及其他犯罪，如诈骗、敲诈勒索等，否则一般难以追究其刑事责任。
- 关键点：这需要您根据具体情况，咨询专业律师，评估是否有可能追究“小三”的刑事责任。
三、实际操作建议
收集证据：
- 无论您想要追究“小三”什么责任，都需要收集充分的证据来支持您的主张。
- 证据可以包括聊天记录、短信、邮件、转账记录、照片、视频等。
咨询专业律师：
- 在决定起诉“小三”之前，建议您咨询专业律师，评估案件的可行性和胜诉率。
- 作为专业律师，我可以根据您的具体情况，为您提供详细的法律建议和诉讼策略。
考虑诉讼成本：
- 起诉“小三”可能需要投入大量的时间、精力和金钱。
- 在决定起诉之前，您需要权衡利弊，考虑诉讼成本是否值得。
最后，我想强调的是，婚姻是两个人之间的事情，出现问题时应该首先尝试通过沟通、协商等方式解决。如果确实无法挽回，再考虑通过法律途径来维护自己的权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。