底薪包含加班费是违法的，这种行为侵害了劳动者的合法权益。下面我将从法律依据、法理分析、实际案例及劳动者权益保护等多个角度为你详细解释：
一、法律依据
《中华人民共和国劳动法》第四十四条：
- 安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- 法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
《关于工资总额组成的规定》第四条：
- 工资总额由计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、加班加点工资、特殊情况下支付的工资六个部分组成。这明确指出了加班加点工资是工资总额的一部分，但它是独立于底薪之外的额外薪资部分。
二、法理分析
底薪与加班费的性质不同：
- 底薪是劳动者在正常工作时间内提供正常劳动所获得的基本报酬，是固定的薪资部分，主要依据劳动者的工作岗位、技能水平、工作经验等因素确定。
- 加班费则是劳动者按照用人单位生产和工作的需要在规定工作时间之外继续生产劳动或者工作所获得的劳动报酬，是对劳动者额外劳动的一种补偿。
将加班费包含在底薪中的违法性：
- 将加班费包含在底薪中，实际上降低了劳动者在正常工作时间内的工资标准，同时免除了用人单位支付额外加班费的义务。这明显违反了法律关于加班费支付的强制性规定，也严重侵害了劳动者的合法权益。
三、实际案例及劳动者权益保护
实际案例：
- 假设某劳动者的月底薪为3000元，本月他加班了10个小时。按照法律规定，公司应按照该劳动者的正常小时工资标准的1.5倍（平时加班）支付加班费。如果公司声称这3000元已经包含了加班费，那么这显然是不符合法律规定的。劳动者有权要求公司按照其正常小时工资标准额外支付10个小时的加班工资。
劳动者权益保护：
- 协商：劳动者首先应与用人单位进行协商，要求其按照法律规定足额支付加班费。
- 投诉：若协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门对用人单位的违法行为进行调查，并责令其限期支付加班费。
- 仲裁与诉讼：劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，请求裁决用人单位支付加班费及可能的赔偿金。如对仲裁结果不服，还可向人民法院提起诉讼，通过司法程序维护自己的合法权益。
四、建议
- 劳动者：应充分了解自己的权益，包括底薪和加班费的支付标准。在遇到用人单位将加班费包含在底薪中的违法行为时，要积极采取措施维护自己的权益。
- 用人单位：应严格遵守相关法律法规，确保底薪与加班费的独立计算与支付。这不仅是维护劳动者合法权益的需要，也是避免潜在法律风险、构建和谐劳动关系的必要举措。
综上所述，底薪包含加班费是违法的，劳动者应了解自己的合法权益，并在遇到此类情况时采取适当的措施来维护自己的权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。