关于存量房买卖合同一式四份，买卖双方各持一份，另两份未注明去向的风险，主要可以从以下几个方面进行分析：

1. 合同备案与监管风险：

   • 在房屋买卖交易中，合同通常需要向相关部门（如房地产管理部门或不动产登记中心）进行备案，以确保交易的合法性和透明度。如果未注明的两份合同未被妥善保管或用于备案，可能导致交易无法得到官方认可，进而影响房屋所有权的转移登记。
   • 建议：确保所有合同副本都得到妥善保管，并按照当地房地产管理部门的要求进行备案。如果可能，与交易对方协商，明确未注明去向的两份合同的用途和保管方式。

2. 合同履行与证据风险：

   • 合同是双方履行义务和享有权利的依据。如果未注明的两份合同落入第三方手中，且该第三方与交易存在利害关系，可能会利用这些合同作为证据，对交易双方产生不利影响。例如，第三方可能试图主张自己对房屋的权利，或者利用合同中的条款进行欺诈。
   • 建议：在交易过程中，保持对合同副本的严格控制，避免泄露给无关第三方。如果发现合同副本丢失或被盗，应立即采取措施，如报警、通知交易对方等，以减少潜在风险。

3. 法律纠纷与诉讼风险：

   • 如果因合同问题引发法律纠纷，未注明的两份合同可能成为关键证据。如果这些合同无法找到或内容存在争议，可能导致诉讼结果的不确定性增加，甚至可能对一方造成不利后果。
   • 建议：在交易前，对合同条款进行仔细审查，确保合同内容明确、无歧义。在交易过程中，保留好所有与交易相关的证据，包括合同副本、付款凭证、沟通记录等。如果发生纠纷，及时咨询专业律师，制定合适的诉讼策略。

4. 实际操作与便利性风险：

   • 从实际操作的角度来看，如果未注明的两份合同被用于不同的目的（如一份用于银行贷款审批，一份用于税务申报），而交易双方并不知情，可能会导致操作上的混乱和不便。
   • 建议：在交易前，与交易对方明确合同副本的用途和数量，确保双方对合同的使用有清晰的了解。在交易过程中，保持沟通畅通，及时解决因合同副本使用而产生的问题。

总结与建议：

• 存量房买卖合同一式四份，买卖双方各持一份是常见的做法。然而，对于未注明的两份合同，应谨慎处理以避免潜在风险。
• 建议交易双方在交易前明确合同副本的用途、数量和保管方式，并确保所有合同副本都得到妥善保管和备案。如果可能，可以咨询专业律师或房地产中介机构的意见，以确保交易的合法性和安全性。

在房屋买卖交易中，合同的重要性不言而喻。因此，务必对合同的管理和使用给予足够的重视。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。