若发改委批复的价格低于PPP合同约定价格，核心处理思路需结合合同条款、法律程序及协商机制综合判断，具体分以下情况处理：

1. 优先核查PPP合同条款

• 价格调整机制：若合同中明确约定了“政府方有权根据政策调整价格”或“价格需经审批后生效”等条款，则发改委的批复可能构成合同履行的依据，此时需按批复价格执行，但可依据合同主张补偿（如前期投入损失、合理利润差额等）。
• 违约责任条款：若合同未约定价格调整机制，或明确排除政府单方调价权，则发改委批复可能构成“情势变更”或“行政行为干预合同履行”，此时可主张：
  • 协商变更合同：与政府方重新谈判，争取通过补充协议调整价格或补偿方案；
  • 诉讼/仲裁：若协商无果，可依据《民法典》第533条（情势变更）或第577条（违约责任）提起程序，要求政府方承担违约责任或补偿损失。

2. 分析发改委批复的合法性

• 程序合法性：核查发改委批复是否符合法定程序（如是否经过听证、是否超越职权等）。若批复程序违法，可提起行政复议或行政诉讼，请求撤销批复，恢复原合同价格。
• 实体合法性：若批复依据的政策文件（如价格调控政策）与PPP合同冲突，需评估政策文件的效力层级。若政策文件属于“上位法”或“公共利益需要”，可能优先适用，但政府方仍需依据《政府和社会资本合作项目财政管理暂行办法》等规定，对投资者进行合理补偿。

3. 协商与补偿路径

• 直接协商：向政府方提交书面函件，说明批复价格与合同差异对项目的影响（如融资成本、运营亏损等），要求重新谈判价格或提供补贴、税收优惠等补偿措施。
• 引入第三方评估：若双方对损失金额存在争议，可共同委托第三方机构评估项目实际成本与合理利润，作为协商或诉讼的依据。

4. 风险防范建议

• 合同起草阶段：未来签订PPP合同时，建议明确约定价格调整机制（如挂钩CPI、行业指数等）、政府调价的程序限制（如需提前通知、听证等）及违约补偿条款，减少争议风险。
• 项目执行阶段：密切关注政策动态，在发改委启动调价程序时及时介入，通过参与听证、提交意见等方式维护权益。

总结：发改委批复价格低于合同约定时，需结合合同条款、批复合法性及补偿可能性综合应对。建议优先协商，若无法解决则通过法律程序主张权利，同时未来签约时完善风险分配条款。如有具体合同文本或批复文件，可进一步分析细节后提供针对性方案。