结论：私自侵占公司财产被领导私下罚款的行为，在大多数情况下是违法的。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律角度
罚款权归属：
- 根据我国相关法律规定，罚款作为一种行政处罚或经济制裁措施，其行使主体具有特定性。一般来说，只有国家行政机关或法律授权的组织才有权对违法行为进行罚款。
- 公司领导作为个人或公司管理者，并不具备法律赋予的罚款权。因此，他们无权对员工进行私下罚款。
侵占公司财产的法律后果：
- 私自侵占公司财产可能构成职务侵占罪或贪污罪（如果涉及国家工作人员），具体取决于侵占者的身份和侵占财产的性质。
- 对于这类犯罪行为，应当由司法机关依法进行侦查、起诉和审判，而不是由公司领导私下处理。
公司内部规章制度的合法性：
- 虽然公司可以制定内部规章制度来规范员工行为，但这些规章制度必须符合法律法规的规定，且不得侵犯员工的合法权益。
- 如果公司规章制度中规定了罚款条款，且该条款与法律法规相抵触或侵犯了员工权益，那么该条款是无效的。
二、实际操作角度
私下罚款的无效性：
- 即使公司领导以内部规章制度为由对员工进行私下罚款，这种罚款也是无效的。因为罚款权不属于公司领导，且私下罚款可能违反法律法规和公平原则。
员工权益保护：
- 员工有权拒绝接受不合理的私下罚款，并可以向公司上级或相关部门投诉。
- 如果员工因拒绝私下罚款而遭受报复或歧视，他们还可以依法维护自己的合法权益。
三、建议与措施
对于公司领导：
- 应遵守法律法规，不得滥用权力对员工进行私下罚款。
- 如果发现员工有侵占公司财产的行为，应及时向司法机关报案，并配合调查处理。
对于员工：
- 应了解自己的合法权益，拒绝接受不合理的私下罚款。
- 如果遭受不公平待遇或侵权行为，应及时向公司上级、相关部门或司法机关寻求帮助。
举例说明：假设某公司员工小张私自侵占了公司的一笔资金，公司领导得知后，决定对小张进行私下罚款。这种行为就是违法的，因为公司领导没有罚款权，且私下罚款可能违反法律法规和公平原则。小张有权拒绝接受这种罚款，并可以向公司上级或相关部门投诉。
进一步思考：在实际操作中，公司应建立健全的内部管理制度和监督机制，确保员工行为的合规性和公司财产的安全。同时，员工也应增强法律意识，了解自己的合法权益和义务，共同维护公司的正常运营和良好秩序。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。