结论：挂靠公司抵押了绿本（机动车登记证书），但车辆仍在车主正常使用，这一行为是否违法需分情况讨论。一般来说，若车主不知情且未授权，挂靠公司的行为涉嫌违法；若车主知情并同意，则可能不构成违法，但需关注抵押合同的合法性和有效性。
分析：
车主不知情且未授权的情况：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，抵押权设立需要抵押人与抵押权人达成合意，并办理抵押登记。若车主作为车辆的实际所有人，对抵押行为不知情且未授权，则挂靠公司无权擅自将车辆抵押。
- 法律后果：挂靠公司的行为可能构成无权处分，车主有权要求挂靠公司撤销抵押，并可能追究其法律责任，如赔偿损失等。同时，若抵押权人（如银行或其他金融机构）在不知情的情况下接受了抵押，且已办理了抵押登记，车主也可能需要与抵押权人协商解决，或通过法律途径主张自己的权益。
车主知情并同意的情况：
- 法律背景：若车主知情并同意挂靠公司将车辆抵押，且双方签订了合法的抵押合同，并办理了抵押登记，则这一行为在法律上是有效的。但需注意，抵押合同的合法性和有效性需满足相关法律法规的规定，如合同内容合法、双方意思表示真实等。
- 法律建议：即使车主知情并同意抵押，也应确保抵押合同的合法性和有效性，避免后续产生纠纷。同时，车主应了解抵押可能带来的风险，如车辆被处置等，并做好相应的风险防范措施。
额外考虑因素：
- 挂靠关系的性质：挂靠关系通常指个人或单位将车辆挂靠在另一单位名下，以该单位的名义从事经营活动。在挂靠关系中，车辆的实际所有人与名义所有人可能不一致，这增加了法律关系的复杂性。因此，在处理抵押问题时，需明确车辆的实际所有权和名义所有权，以及双方的权利义务关系。
- 抵押物的处置：若挂靠公司未能按时偿还债务，抵押权人可能依法对抵押物（即车辆）进行处置。这将对车主的权益产生直接影响。因此，车主在同意抵押前，应充分了解抵押可能带来的后果，并谨慎决策。
建议行动：
- 若车主对抵押行为不知情且未授权，应立即与挂靠公司联系，要求其撤销抵押，并保留相关证据以备后续维权。
- 若车主知情并同意抵押，但担心抵押合同的合法性和有效性，或担心抵押可能带来的风险，可咨询专业律师，对抵押合同进行审查，并了解相关法律风险和防范措施。
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