每班12小时两班倒的工作制度是否违法，需分情况讨论：

1. 从劳动法关于工作时间的规定来看：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是法律对劳动者工作时间的基本规定，旨在保障劳动者的休息权和健康权。
   • 若企业实行每班12小时两班倒的工作制度，且未获得劳动行政部门的批准实行不定时工作制或综合计算工时工作制，那么这种工作制度显然违反了劳动法关于工作时间的规定。因为劳动者每日工作时间超过了八小时，且很可能导致平均每周工作时间也超过四十四小时。

2. 从加班和休息休假的规定来看：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
   • 在每班12小时两班倒的工作制度下，劳动者每日工作时间远超法定加班时间限制，且很可能无法保证足够的休息时间，这同样违反了劳动法关于加班和休息休假的规定。

3. 从特殊工时制度的适用来看：

   • 虽然劳动法规定了标准工时制度，但也允许企业实行不定时工作制或综合计算工时工作制等特殊工时制度。然而，这些特殊工时制度的实行需要获得劳动行政部门的批准，并且必须确保劳动者的休息权和健康权不受侵害。
   • 如果企业未经批准就实行每班12小时两班倒的工作制度，或者虽然获得了批准但未能保障劳动者的休息权和健康权，那么这种工作制度仍然是违法的。

建议与后果：

• 对于劳动者而言，如果发现自己所在的企业实行了违法的每班12小时两班倒工作制度，可以向当地的劳动行政部门投诉或举报，要求企业改正违法行为并支付相应的加班费或补偿。
• 对于企业而言，如果违反了劳动法关于工作时间、加班和休息休假的规定，可能会面临劳动行政部门的处罚，包括罚款、责令改正等。同时，还可能因侵犯劳动者的合法权益而承担民事赔偿责任。

总结：每班12小时两班倒的工作制度在未经劳动行政部门批准且未保障劳动者休息权和健康权的情况下是违法的。如果你或你身边的人遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律建议。