结论：单位以老板被纪委调查为由，声称人事关系冻结并拒绝为职工办理退休，这一做法通常不合法。以下从多个角度进行分析：
一、法律角度
退休是职工的法定权利：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，职工达到法定退休年龄时，有权享受基本养老保险待遇，单位应当为其办理退休手续。
- 退休手续的办理是单位的法定义务，不应因单位内部管理问题（如老板被纪委调查）而受到影响。
人事关系冻结的合法性存疑：
- 人事关系冻结通常不是法律术语，且没有明确的法律依据支持单位可以因老板被调查而冻结所有人事关系。
- 即使单位内部有相关规定或政策，这些规定或政策也不得违反法律法规的强制性规定，否则无效。
二、实际操作角度
单位应履行法定义务：
- 无论单位内部发生何种情况，单位都应继续履行其法定义务，包括为职工办理退休手续。
- 如果单位因老板被调查而无法正常运营，应寻求法律途径解决内部问题，而不是将问题转嫁给职工。
职工可采取的措施：
- 职工可以与单位协商，要求单位按照法律规定为其办理退休手续。
- 如果协商无果，职工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
三、特殊情况考虑
单位确实无法办理退休手续：
- 如果单位因老板被调查等极端情况确实无法办理退休手续，且这种情况是暂时的、非单位主观故意的，职工可以给予一定的理解和宽限期。
- 但宽限期不应过长，且单位应尽快恢复正常运营或采取其他措施解决职工退休问题。
单位存在恶意拖延或拒绝办理：
- 如果单位存在恶意拖延或拒绝为职工办理退休手续的行为，职工应坚决维护自己的权益，通过法律途径解决。
建议：
- 职工应保留好与单位沟通的记录、工作证明、社保缴纳记录等相关证据，以备不时之需。
- 在与单位协商或申请劳动仲裁时，职工可以寻求专业律师的帮助，以提高维权效率和成功率。
后续行动：
- 如果您遇到类似情况，且单位拒绝为您办理退休手续，建议您首先与单位进行友好协商，明确表达您的诉求和法律依据。
- 如果协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，我会根据您的具体情况提供进一步的法律建议和支持。