结论：项目未竣工甲方未付款时，乙方预交税款的行为本身并不直接违法，但需结合具体合同约定、税法规定及交易习惯综合判断其合理性及潜在风险。 以下是具体分析：

1. 从合同履行角度看
   若合同明确约定“乙方需在收到甲方付款前预缴税款”，或双方交易习惯中存在此类操作，则乙方预交税款属于履行合同义务的行为，不违法。但需注意：

   • 合同条款需符合《民法典》第143条（民事法律行为有效要件），即双方意思表示真实、不违反法律强制性规定；
     
   • 若甲方未付款导致乙方资金紧张，乙方可依据《民法典》第527条主张不安抗辩权，要求甲方提供担保或提前付款后再缴税。

2. 从税法规定角度看
   根据《增值税暂行条例》第19条，增值税纳税义务发生时间为“收讫销售款项或者取得索取销售款项凭据的当天”。若项目未竣工但乙方已开具发票或实际收款（如预收款），则需按税法规定申报纳税，此时预交税款是法定义务，不违法。

   • 例外情形：若合同约定“甲方付款后乙方再开票纳税”，而甲方未付款导致乙方未开票且未实际收款，则乙方可能无需立即缴税。但需结合具体税种（如企业所得税、土地增值税等）的纳税义务发生时间综合判断。

3. 潜在风险与建议

   • 资金风险：若甲方长期未付款，乙方预交税款可能导致资金链紧张，建议通过合同约定“税款由甲方承担”或“甲方付款后乙方再缴税”转移风险；
     
   • 税务合规风险：若乙方未按规定申报纳税（如应缴未缴），可能面临税务机关处罚（《税收征收管理法》第63条）。建议保留完税凭证、合同等证据，证明缴税行为的合法性；
     
   • 争议解决：若双方对预交税款产生争议，可依据《民法典》第510条（合同补充约定）或第511条（交易习惯）协商解决，协商不成可诉讼或仲裁。

总结：预交税款是否合法需结合合同、税法及交易习惯综合判断。建议乙方在操作前审查合同条款、咨询税务机关，并保留相关证据以规避风险。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律应对方案。