市场监管部门认为认定企业违法事实证据不足而不予立案，主要依据的是《市场监督管理行政处罚程序规定》等相关法律法规中关于立案条件及证据要求的规定。以下从不同角度为您详细分析：

1. 法律依据之立案条件：

   • 根据《市场监督管理行政处罚程序规定》第十九条，市场监督管理部门在接到举报或发现违法行为线索后，若认为有证据初步证明存在违法行为，且属于本部门管辖范围，应当予以立案。反之，若证据不足或无法证明存在违法行为，则不予立案。
   • 这一规定明确了立案的基本条件，即必须有初步证据证明存在违法行为。若证据不足，市场监管部门有权决定不予立案。

2. 证据要求与认定：

   • 证据是认定违法事实的基础。在行政处罚程序中，市场监管部门需要收集足够的证据来支持其对企业违法行为的认定。这些证据可能包括书证、物证、视听资料、电子数据、证人证言、鉴定意见等。
   • 若市场监管部门在调查过程中发现，所收集的证据无法充分证明企业存在违法行为，或者证据之间存在矛盾无法形成完整的证据链，那么根据证据规则，市场监管部门将无法认定企业违法事实成立，从而决定不予立案。

3. 不予立案的程序与通知：

   • 根据《市场监督管理行政处罚程序规定》的相关规定，市场监管部门在决定不予立案时，应当制作不予立案审批表，并说明不予立案的理由。
   • 同时，市场监管部门还应当将不予立案的结果通知举报人或相关当事人，并告知其如有异议可以依法申请行政复议或提起行政诉讼。

4. 企业应对建议：

   • 若企业收到市场监管部门不予立案的通知，但认为自身并未违法或市场监管部门的认定存在错误，可以积极与市场监管部门沟通，提供进一步的证据或解释说明。
   • 若沟通无果，企业还可以考虑通过行政复议或行政诉讼等法律途径来维护自身权益。

总结来说，市场监管部门认为认定企业违法事实证据不足而不予立案，是基于《市场监督管理行政处罚程序规定》等法律法规中关于立案条件及证据要求的规定。企业在面对此类情况时，应了解相关法律法规，积极与市场监管部门沟通，并在必要时寻求法律帮助。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。