关于约定加班工资基数是否合规的问题，结论前置如下：
若约定合法且公平合理，则合规：用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定加班工资的计算基数，且该约定不违反法律法规的强制性规定，不低于当地最低工资标准，也不畸低于劳动者正常工作时间工资标准，同时符合公平合理原则，那么这种约定是合规的。
若约定违法或显失公平，则不合规：如果约定的加班工资基数低于法定标准，或者用人单位利用优势地位迫使劳动者接受不合理的约定，导致显失公平，那么这种约定是不合规的。
详细分析如下：
合法性要求
不得低于法定标准：根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，加班工资的计算基数不得低于当地规定的最低工资标准，也不得畸低于劳动者正常工作时间工资标准。这是为了保障劳动者的基本生活需求，防止用人单位通过约定过低的加班工资基数来规避法律责任。
遵循公平合理原则：加班工资基数的约定还应遵循公平合理原则。用人单位不能利用其优势地位，迫使劳动者签订明显不合理的加班工资基数约定。如果劳动者认为约定不公，有权主张该约定无效，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。
明确性要求
具体计算方式：在劳动合同中，应清晰明确地表述加班工资计算基数的具体确定方式。例如，应明确是以基本工资、岗位工资还是其他工资构成部分作为加班工资计算基数。这样可以避免在发生纠纷时因约定不明确而产生争议。
书面形式：约定加班工资计算基数应采用书面形式，并在劳动合同中进行详细明确的条款约定。这是为了确保在发生纠纷时有据可依，保护双方的合法权益。
实际操作中的考虑
地区差异与政策：不同地区的最低工资标准和加班费规定可能有所不同。因此，在具体判断约定加班工资基数是否合规时，需要结合当地的法律法规和政策文件进行综合考虑。
劳动者权益保护：劳动者如认为自己的加班费计算方式存在问题，可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助来维护自己的合法权益。同时，用人单位也应定期审查和调整相关约定，以确保其符合最新的法律法规要求。
举例说明：
假设某地区最低工资标准为每月2000元，劳动者正常工作时间工资为每月3000元。如果用人单位与劳动者在劳动合同中约定加班工资计算基数为2500元（高于最低工资标准且不低于正常工作时间工资的合理比例），且该约定是双方平等自愿、协商一致的结果，那么这种约定是合规的。
相反，如果用人单位与劳动者约定加班工资计算基数为1500元（低于最低工资标准），或者利用优势地位迫使劳动者接受这一不合理的约定，那么这种约定是不合规的，劳动者有权主张该约定无效。
建议：
为了确保约定加班工资基数的合规性，用人单位和劳动者在签订劳动合同时应充分沟通、协商一致，并明确具体计算方式和工资结构。同时，双方应关注当地的法律法规和政策文件，确保约定符合最新要求。如有任何疑问或争议，可以直接向我咨询，我将提供专业的法律意见和帮助。