劳动合同中可以约定加班工资基数，但该约定必须合法、明确、公平合理，并确保劳动者的合法权益不受损害。以下是对这一问题的详细分析：
一、约定的合法性与有效性
根据《劳动法》及相关规定，用人单位与劳动者在签订劳动合同时，可以明确约定加班工资的计算基数。这种约定在双方自愿、平等且协商一致的基础上达成，且不违反国家法律法规的强制性规定，因此是合法有效的。但需注意，该约定工资数额不得低于当地最低工资标准，这是保障劳动者基本生活和合法权益的底线要求。若劳动合同中约定的加班工资计算基数低于当地最低工资标准，则该约定无效，应按照法定标准执行。
二、约定的具体注意事项
明确计算基数的构成：
- 约定中应明确是以基本工资、岗位工资、绩效工资等何种工资构成部分作为加班工资计算基数。例如，可以约定“加班工资计算基数为乙方的基本工资和岗位工资之和”。
- 避免使用模糊不清的表述，如“按公司规定执行”或“按实际发放工资计算”等，以减少后续可能产生的争议。
遵循公平合理原则：
- 计算基数的约定应在合理范围内，不能过分压低劳动者的加班报酬。若约定明显不合理，损害了劳动者的合法权益，在发生劳动争议时，可能会被认定为无效约定，并按照法定标准来确定加班工资计算基数。
- 例如，若劳动者的正常工作时间工资为每月5000元，而劳动合同中约定的加班工资计算基数仅为每月2000元，这显然是不合理的，可能被认定为无效。
动态调整与告知义务：
- 加班工资基数并非一成不变，而应随着员工工资的调整而相应调整。用人单位应定期审查和调整加班工资基数，确保其始终符合法律法规的要求，并公平对待每一位员工。
- 同时，用人单位还有义务将加班工资基数的约定情况明确告知劳动者，确保劳动者知晓并理解相关内容。这可以通过在劳动合同中明确约定、在规章制度中规定或通过其他书面形式告知劳动者。
三、加班工资计算基数的确定方式
劳动合同有约定：
- 当劳动合同中有明确约定时，应按照劳动合同的约定执行加班工资的计算。但需注意，该约定工资数额不得低于当地最低工资标准。
劳动合同无约定：
- 若劳动合同中没有约定加班工资计算基数，则按照以下顺序确定：
- 首先，按照集体合同的约定执行；
- 若集体合同也未约定，可由用人单位与职工代表通过工资集体协商确定，并签订工资集体协议；
- 若无任何约定，则按劳动者本人所在岗位（职位）正常出勤的月工资的70%确定，但同样不得低于当地最低工资标准。
特殊工资制度：
- 对于实行计件工资的劳动者，在完成计件定额任务后，由用人单位安排延长工作时间的，应根据上述原则，分别按照不低于其本人法定工作时间计件单价的150%、200%、300%支付其工资。
- 对于实行综合计算工时工作制的劳动者，当综合计算周期为季度或年度时，应将综合周期内的月平均工资作为加班费计算基数。
四、法律后果与风险提示
- 若用人单位未按照约定或法定标准支付加班工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付拖欠的加班工资及可能的经济补偿金。
- 若用人单位在劳动合同中约定的加班工资计算基数低于法定标准，该约定可能被认定为无效，用人单位需按照法定标准支付加班工资，并可能面临劳动监察部门的处罚。
总结与建议：
劳动合同中约定加班工资基数是一项涉及劳动者切身利益的重要事项。用人单位应严格遵守法律法规，确保约定的基数合法、公平、明确，并随员工工资调整而相应调整。同时，加强内部沟通和告知义务，维护良好的劳动关系，促进企业的和谐稳定发展。若您在劳动合同签订或加班工资计算方面遇到任何问题，欢迎直接向我咨询。