结论：员工犯重大过错导致公司损失，但正在怀孕期间，公司是否可以开除该员工，需分情况讨论。一般情况下，怀孕女职工受到特殊保护，公司不能随意开除；但若女职工存在严重违反用人单位规章制度等法定可解除劳动合同的情形，公司仍可依法解除劳动合同。
分析说明：
怀孕女职工的特殊保护：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，怀孕女职工在孕期、产期、哺乳期内，享受特殊的劳动保护。用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同。这是为了保障女职工的合法权益，确保其能够安心孕育和抚养子女。
法定可解除劳动合同的情形：
- 尽管怀孕女职工受到特殊保护，但并非在任何情况下都不能被开除。如果女职工存在严重违反用人单位的规章制度、严重失职、营私舞弊给用人单位造成重大损害等法定可解除劳动合同的情形，用人单位仍然可以依法解除劳动合同。
- 在您提到的情况中，如果员工犯有重大过错导致公司损失，且这一过错符合法定可解除劳动合同的情形（如严重违反公司规章制度、严重失职等），那么公司有权依法解除与该员工的劳动合同，即使该员工正在怀孕期间。
公司解除劳动合同的程序和注意事项：
- 如果公司决定解除与怀孕女职工的劳动合同，必须确保解除行为符合法律法规的规定，并遵循相应的程序。例如，公司需要证明女职工的过错行为确实存在，且该行为达到了法定可解除劳动合同的程度；同时，公司还需要按照法律法规的规定，向女职工支付相应的经济补偿（如果适用）。
- 此外，公司还需要注意保护女职工的隐私和尊严，避免在解除劳动合同过程中对其造成不必要的伤害。
行动建议：
- 对于公司：在决定是否解除与怀孕女职工的劳动合同时，应谨慎评估女职工的过错行为是否达到法定可解除劳动合同的程度，并确保解除行为符合法律法规的规定和程序。如果存在疑问或不确定的情况，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见。
- 对于员工：如果认为自己被公司违法解除劳动合同，可以依法向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，维护自己的合法权益。同时，也可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
后续思考：在实际操作中，公司应建立健全的规章制度和内部管理机制，明确员工的行为规范和奖惩措施。这样可以在遇到类似情况时，有明确的依据和标准来处理，减少争议和纠纷的发生。同时，员工也应自觉遵守公司的规章制度和法律法规，共同维护良好的劳动关系和工作环境。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。