结论：公司不认可劳动关系，并不直接导致工伤部门无法进行工伤认定。工伤认定是一个独立的法律程序，其核心在于确认伤害是否符合工伤的法定条件，而非单纯依赖于公司对劳动关系的认可。

详细分析：

1. 工伤认定的法律依据：

   • 根据《工伤保险条例》及相关法律法规，工伤认定的主要依据是伤害是否发生在工作时间和工作场所内，是否因工作原因受到事故伤害，或者是否符合其他法定的工伤情形。
   • 劳动关系是工伤认定的一个重要前提，但并非唯一前提。即使公司不认可劳动关系，劳动者仍可以通过提供其他证据（如工资支付记录、工作证、考勤记录等）来证明其与公司之间存在事实劳动关系。

2. 工伤认定的程序：

   • 劳动者在发生工伤后，应及时向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 社会保险行政部门在受理申请后，会进行调查核实，包括核实劳动关系、伤害事实等。
   • 如果公司不认可劳动关系，社会保险行政部门会要求公司提供相关证据，并可能要求劳动者提供反驳证据。在双方证据充分的情况下，社会保险行政部门会依法作出工伤认定决定。

3. 公司不认可劳动关系的处理：

   • 如果公司不认可劳动关系，劳动者可以通过劳动争议仲裁或诉讼等法律途径来确认劳动关系。
   • 在确认劳动关系后，劳动者可以再次向社会保险行政部门提出工伤认定申请，或者要求社会保险行政部门根据已确认的劳动关系进行工伤认定。

4. 可能的法律后果：

   • 如果劳动者能够证明其与公司之间存在事实劳动关系，并且伤害符合工伤的法定条件，那么社会保险行政部门应当依法作出工伤认定决定。
   • 如果公司仍然不认可工伤认定结果，公司可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，但这并不影响工伤认定的法律效力。在行政复议或行政诉讼期间，工伤认定决定通常不停止执行。

建议：

• 如果您遇到公司不认可劳动关系且拒绝进行工伤认定的情况，建议您及时收集相关证据（如工资支付记录、工作证、考勤记录等）来证明您与公司之间存在事实劳动关系。
• 同时，您可以向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请，并积极配合社会保险行政部门的调查核实工作。
• 如果公司仍然不认可工伤认定结果，您可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。

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