可以申请调查微信收银流水，但能否获得支持需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
仲裁申请调查的法律依据
根据《劳动争议调解仲裁法》第六条，发生劳动争议时，当事人对自己提出的主张有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。虽然个体户老板并非严格意义上的“用人单位”，但仲裁机构在处理争议时，会参照类似原则，要求双方提供与争议相关的证据。微信收银流水作为证明工资金额的关键证据，若您能证明该流水与争议事项直接相关且由对方掌握，可向仲裁机构申请调查取证。
申请调查的可行性条件
- 证据关联性：需证明微信收银流水与工资金额存在直接关联（如流水中的交易记录与工资发放时间、金额吻合，或对方曾通过微信支付工资）。
- 对方掌握证据：需证明微信账号属于对方且流水记录由其控制（如账号实名认证信息、历史交易记录等）。
- 其他途径无法获取：需证明您已通过合理方式（如要求对方提供、自行截图等）尝试获取证据，但未成功。
实务操作建议
- 提前固定证据：在申请调查前，尽可能通过截图、录音、聊天记录等方式固定微信流水的关键信息（如交易时间、金额、对方账号），并保存原始载体（如手机）。
- 书面申请调查：向仲裁机构提交书面申请，明确调查对象（微信账号）、调查内容（特定时间段流水）、关联性说明及对方掌握证据的依据。
- 配合仲裁调查：若仲裁机构同意调查，需配合提供微信账号信息、协助调取流程，并可能需通过腾讯公司等第三方调取数据（需符合法律程序）。
风险提示
- 证据效力限制：若微信流水存在模糊性（如部分交易非工资、账号非对方所有），可能被对方质疑关联性，需结合其他证据（如工资条、考勤记录）佐证。
- 程序复杂性：调取第三方数据（如微信流水）可能需通过法院调查令或仲裁机构与腾讯公司协商，程序耗时较长，需做好心理准备。
总结：您可向仲裁机构申请调查微信收银流水，但需满足关联性、对方掌握证据等条件，并提前固定证据、书面申请。若证据充分且程序合法，仲裁机构可能支持调查请求，否则可能因证据不足或程序障碍被驳回。建议结合其他证据综合举证，以提高胜诉概率。