针对“公司违法行为超过2年怎么办”这一问题，核心结论需结合违法行为的性质、追责时效及法律程序综合判断，以下是具体分析：

1. 行政处罚的追责时效
   根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，原则上不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，时效延长至五年）。

   • 若违法行为未被发现：超过两年后，行政机关通常无法直接处罚公司，但需注意“发现”的认定标准（如举报、检查等时间节点）。
     
   • 若违法行为已被立案或调查：时效中断，行政机关仍可继续追责，不受两年限制。
     
   • 例外情形：如公司违法行为涉及环境污染、食品安全等严重危害后果，可能适用五年追责期。

2. 刑事责任的追诉时效
   若公司行为构成犯罪（如诈骗、非法经营等），需根据《刑法》第八十七条判断追诉期：

   • 法定最高刑不满五年有期徒刑的，追诉期为五年；
     
   • 法定最高刑五年以上不满十年有期徒刑的，追诉期为十年；
     
   • 法定最高刑十年以上有期徒刑的，追诉期为十五年；
     
   • 法定最高刑为无期徒刑、死刑的，追诉期为二十年（若认为必须追诉，需报最高检核准）。
     关键点：追诉期从犯罪之日起计算，犯罪行为有连续或继续状态的，从行为终了之日起计算。若司法机关已立案或受理案件，不受追诉期限制。

3. 民事赔偿的诉讼时效
   若公司违法行为侵害他人民事权益（如合同违约、侵权），根据《民法典》第一百八十八条，诉讼时效为三年，自权利人知道或应当知道权利受损之日起计算。

   • 超过三年：对方可能提出时效抗辩，导致败诉风险，但若存在诉讼时效中断（如协商、催告）或中止（如不可抗力）情形，时效可能重新计算。
     
   • 最长保护期：自权利受损之日起二十年，但特殊情形下法院可延长。

4. 实务建议

   • 公司自查：若为公司自身违法行为，建议立即停止并评估法律风险，主动配合调查或整改可能减轻处罚。
     
   • 受害方应对：若为受害方，需尽快固定证据（如合同、转账记录、沟通记录等），并在时效内提起诉讼或举报。
     
   • 时效计算争议：若对时效起算点有疑问（如“发现时间”认定），可委托律师分析具体案情，争取时效利益。

总结：公司违法行为超过两年是否仍可追责，需结合行为性质（行政/刑事/民事）、时效规定及具体案情判断。若有进一步疑问或需具体案例分析，可直接向我咨询。