针对公司存在多种违法行为的处理，需分情况采取不同策略，具体如下：

1. 内部处理与整改
   若违法行为尚未被外部监管部门发现，公司应立即启动内部调查，明确违法行为的性质、范围及责任人。例如，若涉及财务造假，需由审计部门或外部审计机构介入，核实账目问题；若涉及劳动纠纷，需由人力资源部门梳理用工合同、考勤记录等证据。整改措施需包括：

   • 停止违法行为（如停止虚假宣传、停止违规排污）；
     
   • 修订内部制度（如完善财务审批流程、加强合规培训）；
     
   • 对责任人追责（如警告、降职、解除劳动合同）。
     

2. 主动向监管部门报告
   若违法行为已构成行政违法（如未依法纳税、未办理环保手续），公司可主动向税务、环保等部门报告，并提交整改方案。根据《行政处罚法》第三十二条，主动消除或减轻违法行为危害后果的，可从轻或减轻处罚。例如，某企业未按规定排放废水，主动停产整改并投资升级污水处理设备后，环保部门可能仅作出罚款而非停业整顿的处罚。

3. 应对行政调查与处罚
   若监管部门已立案调查，公司需配合提供证据（如合同、账目、监控录像），并委托律师参与听证程序。行政处罚可能包括罚款、没收违法所得、责令停产停业等。例如，某公司因虚假宣传被市场监管部门罚款20万元，若对处罚决定不服，可在60日内申请行政复议或6个月内提起行政诉讼。

4. 应对刑事风险
   若违法行为涉嫌犯罪（如非法集资、污染环境罪），公司可能面临刑事处罚，包括罚金、单位直接责任人员被判刑。此时需立即委托刑事律师介入，争取从轻情节（如自首、立功、认罪认罚）。例如，某公司因生产销售伪劣产品被追究刑事责任，若能主动召回产品并赔偿消费者损失，可能获得缓刑或减轻罚金。

5. 民事赔偿与信用修复
   若违法行为损害他人权益（如产品质量问题导致消费者受伤），公司需承担民事赔偿责任。赔偿后，可通过公开道歉、参与公益活动等方式修复社会信用。例如，某车企因电池缺陷召回车辆并赔偿用户后，通过发布技术改进报告逐步恢复市场信任。

关键提醒：公司违法行为可能涉及多部门交叉监管（如市场监管、税务、环保、公安），需全面梳理法律风险，避免“头痛医头”的片面处理。若需进一步分析具体违法行为（如税务、环保、劳动等领域的细节），可直接向我咨询。