事业单位与劳动者签订的读研定向协议，其性质究竟是人事争议还是普通合同纠纷，需根据协议的具体内容、签订目的及双方的权利义务关系来综合判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 协议性质判断依据：

   • 人事争议角度：如果读研定向协议主要涉及事业单位与劳动者之间的人事管理关系，如服务期、岗位安排、职称评定等，且协议内容体现了事业单位对劳动者的人事管理权，那么该协议可能被视为人事争议的一部分。人事争议通常涉及事业单位与其工作人员之间因辞职、辞退及履行聘用合同所发生的争议，这类争议往往受到《事业单位人事管理条例》等专门法规的调整。
   • 普通合同纠纷角度：如果读研定向协议主要关注的是双方之间的民事权利义务关系，如学费支付、读研期间的待遇、读研后的工作安排等，且协议内容更侧重于双方之间的平等协商和等价有偿，那么该协议可能被视为普通合同纠纷。普通合同纠纷主要受到《中华人民共和国民法典》中合同编等法律的调整。

2. 具体分析：

   • 协议内容：首先，需要仔细审查协议的具体内容。如果协议中明确规定了事业单位对劳动者的人事管理权，如要求劳动者在读研期间或读研后必须回到原单位工作一定年限，否则需支付违约金等，那么该协议更倾向于被视为人事争议。相反，如果协议主要关注的是双方之间的经济利益关系，如学费的支付与报销、读研期间的工资待遇等，那么该协议更可能被视为普通合同纠纷。
   • 签订目的：其次，需要考虑协议的签订目的。如果事业单位签订协议的主要目的是为了培养特定人才，以满足其长期发展需求，且协议内容体现了对劳动者的人事管理权，那么该协议可能属于人事争议范畴。而如果签订协议的主要目的是为了促进劳动者的个人发展，且双方之间的权利义务关系更加平等和等价有偿，那么该协议可能更倾向于被视为普通合同纠纷。
   • 法律适用：最后，还需要考虑法律适用的问题。如果协议被视为人事争议，那么将适用《事业单位人事管理条例》等相关法规；如果协议被视为普通合同纠纷，那么将适用《中华人民共和国民法典》中合同编等法律。不同的法律适用可能导致不同的法律后果和争议解决方式。

3. 建议：

   • 明确协议性质：在签订读研定向协议时，双方应明确协议的性质和目的，以便在后续履行过程中避免产生争议。
   • 完善协议条款：无论协议被视为人事争议还是普通合同纠纷，双方都应完善协议条款，明确双方的权利义务关系、违约责任等，以减少争议的发生。
   • 寻求法律帮助：如果双方对协议的性质或条款存在争议，建议寻求专业律师的法律帮助，以便更好地维护自己的合法权益。

综上所述，事业单位与劳动者签订的读研定向协议的性质需根据协议的具体内容、签订目的及双方的权利义务关系来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。