公司罚款单没有员工签字通常是不合法的。以下从多个角度对此问题进行分析：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。罚款作为一种对员工工资的扣除，必须遵循法定程序和条件，未经员工签字确认的罚款，可能构成无故拖欠或克扣工资。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》第四条：用人单位在制定、修改或者决定有关劳动纪律等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。罚款作为劳动纪律的一部分，其制定和实施必须遵循民主程序，并确保员工知晓和同意。未经员工签字的罚款单，可能违反了这一程序要求。

3. 《工资支付暂行规定》第十六条：虽然该条款允许用人单位在劳动者本人原因造成经济损失时，按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，并可从工资中扣除，但明确规定了扣除的程序和上限，且并未免除用人单位在实施罚款时需遵循的民主程序和员工签字确认的要求。

二、分析说明

1. 罚款需合法依据和程序：公司若要对员工进行罚款，必须有明确的法律依据或双方约定的合理事由，并且罚款的程序必须合规，包括告知员工罚款的原因、金额及依据，听取员工的陈述和申辩等。未经员工签字确认的罚款单，缺乏这些关键程序，因此可能构成违法。

2. 员工签字的重要性：员工签字是确认罚款事实、金额及接受处罚的重要证据。它不仅体现了员工对罚款的认可，也是公司实施罚款的合法性基础。未经员工签字的罚款单，在法律上可能缺乏效力，无法作为公司扣减员工工资的依据。

三、可能后果

1. 劳动争议：未经员工签字的罚款单可能引发劳动争议，员工可能以此为由向劳动仲裁机构或法院提起申诉，要求公司撤销罚款决定并补发被扣减的工资。

2. 行政处罚：如果公司的罚款行为被认定为违法，劳动保障行政部门可能对公司进行行政处罚，包括责令限期支付劳动者的工资报酬、加付赔偿金等。

四、建议措施

1. 完善规章制度：公司应依法建立和完善劳动规章制度，明确罚款的情形、程序及标准，并确保这些规章制度经过民主程序制定和公示。

2. 加强沟通协商：在实施罚款前，公司应与员工进行充分的沟通和协商，确保员工了解罚款的原因、金额及依据，并听取其陈述和申辩。在双方达成一致后，再要求员工签字确认罚款单。

3. 保留相关证据：公司应妥善保留与罚款相关的证据材料，如员工违纪事实的记录、罚款通知书的送达回证等，以备不时之需。

综上所述，公司罚款单没有员工签字通常是不合法的。为了确保罚款的合法性和有效性，公司应遵循法定程序和条件，加强与员工的沟通协商，并妥善保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。