结论：未完成公司任务罚跑三公里这一做法，在大多数情况下是不合理的，且可能涉及违法。以下从多个角度进行分析：
从劳动法的角度来看：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当保障劳动者的合法权益，不得对劳动者进行体罚或变相体罚。罚跑三公里可以视为一种体罚行为，它侵犯了劳动者的人身权利和尊严。
- 劳动法还规定，用人单位应当建立合理的劳动纪律和规章制度，但这些制度必须符合法律法规的规定，且不得侵犯劳动者的合法权益。如果公司以未完成任务为由对员工进行罚跑，这种制度显然是不合法的。
从公司规章制度的角度来看：
- 即使公司内部有规章制度规定未完成任务需要接受某种惩罚，但这种惩罚也必须是合法、合理且不侵犯员工权益的。罚跑三公里作为一种惩罚方式，很难被视为合理且不侵犯员工权益的。
- 此外，公司规章制度在制定时应当经过民主程序，并告知员工。如果员工对规章制度不知情或未参与制定，那么该规章制度对员工可能不具有约束力。
从实际操作和后果的角度来看：
- 罚跑三公里可能对员工的身体健康造成不良影响，尤其是对于那些身体状况不佳或年龄较大的员工来说，这种惩罚方式可能更加危险。
- 如果员工因为罚跑而受伤或发生其他意外情况，公司可能需要承担相应的法律责任。这不仅会给公司带来经济损失，还会影响公司的声誉和形象。
建议：
- 对于员工来说，如果遇到公司以未完成任务为由进行罚跑等不合理惩罚，应当及时向公司提出异议，并保留相关证据。如果公司不予理会或处理不当，员工可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 对于公司来说，应当建立合法、合理且不侵犯员工权益的劳动纪律和规章制度。在制定惩罚措施时，应当充分考虑员工的实际情况和感受，避免采用过于严厉或侵犯员工权益的惩罚方式。
可能法律后果：
- 如果公司坚持实施罚跑等不合理惩罚措施，可能会面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。
- 如果员工因为罚跑而受伤或发生其他意外情况，公司可能需要承担医疗费用、赔偿金等法律责任。
总之，未完成公司任务罚跑三公里这一做法是不合理的，且可能涉及违法。无论是员工还是公司，都应当遵守相关法律法规和规章制度，共同维护和谐的劳动关系。如果你还有其他关于劳动工伤方面的问题，可以直接向我咨询。