结论：当第三人以房产为被执行人提供担保，而申请人不同意时，处理方式主要取决于担保的具体形式、是否已经完成相关法律程序以及各方的协商情况。以下是从不同角度给出的详细分析和建议。
一、担保形式与法律程序
如果担保尚未完成法律程序：
- 在这种情况下，由于担保关系尚未正式确立，申请人有权表达不同意，并可以阻止担保的完成。第三人无法单方面以房产为被执行人设立担保，除非得到申请人的明确同意或符合法律规定的特定情形（如法院裁定等）。
如果担保已经完成法律程序：
- 一旦担保关系通过合法程序（如签订抵押合同、办理抵押登记等）确立，申请人就难以直接阻止担保的效力。此时，如果申请人不同意该担保，可能需要通过法律途径来寻求救济，如提起诉讼要求确认担保无效或撤销担保等。但这类诉讼的成功率取决于具体案情和法律规定，且可能面临较高的法律风险和成本。
二、协商与调解
- 协商：在担保关系确立前后，各方都可以尝试通过协商来解决问题。申请人可以与被执行人和第三人沟通，表达不同意担保的意见，并寻求其他解决方案，如要求被执行人提供其他形式的担保或增加还款保障措施等。
- 调解：如果协商无果，各方可以考虑通过调解来化解纠纷。调解可以由第三方机构或个人主持，帮助各方达成妥协和协议。调解的优势在于成本较低、效率较高，且有助于维护各方之间的关系。
三、法律救济途径
提起诉讼：
- 如果申请人认为担保关系存在违法情形或损害其合法权益，可以向法院提起诉讼，要求确认担保无效或撤销担保。在诉讼过程中，申请人需要提供充分的证据来支持其主张，并承担相应的举证责任。
申请执行异议：
- 如果担保关系已经确立，并且被执行人未能履行还款义务，导致房产面临被执行的风险，申请人可以在执行过程中提出异议。根据《民事诉讼法》的相关规定，执行异议是当事人或利害关系人对执行行为或执行标的提出的书面异议。如果异议成立，法院可能会裁定中止执行或撤销执行行为。
四、实际操作建议
- 及时咨询专业律师：在处理此类复杂法律问题时，建议申请人及时咨询专业律师的意见。律师可以根据具体案情和法律规定，为申请人提供针对性的法律建议和解决方案。
- 保留相关证据：无论采取哪种处理方式，申请人都应保留好与担保关系相关的所有证据，如抵押合同、抵押登记证明、沟通记录等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。
最后，需要强调的是，每个案件的具体情况都是独特的，因此上述分析和建议仅供参考。在实际操作中，申请人应根据自己的具体情况和法律规定来选择合适的处理方式。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。