结论：法院在审理案件时，若对合同“三性”（即合法性、真实性、关联性）不认定且对争议焦点不提及而直接驳回起诉，这一做法是否合法，需结合具体情形来判断，一般情况下，若法院未依法进行审理即驳回起诉，可能构成程序违法；但若存在法定驳回起诉的情形，则驳回起诉是合法的。以下是对此问题的详细分析：
一、合同“三性”不认定与驳回起诉的关系
合同“三性”的认定：
- 合法性：指合同内容是否违反法律、行政法规的强制性规定，是否违背公序良俗。
- 真实性：指合同是否真实存在，合同条款是否双方真实意思表示，是否存在欺诈、胁迫等情形。
- 关联性：指合同与案件争议焦点是否具有直接联系，能否作为认定案件事实的依据。
不认定合同“三性”的后果：
- 若法院不认定合同的“三性”，通常意味着法院认为该合同不能作为认定案件事实的依据，但这并不直接等同于驳回起诉。法院应进一步分析案件其他证据和事实，以确定是否应支持原告的诉讼请求或驳回其起诉。
二、对争议焦点不提及与驳回起诉的关系
争议焦点的确定：
- 争议焦点是案件审理的核心，是双方当事人争议的主要问题。法院在审理案件时，应明确争议焦点，并围绕争议焦点进行审理。
不提及争议焦点的后果：
- 若法院在审理过程中未提及争议焦点，可能意味着法院未对案件进行充分审理，未就双方当事人的争议问题进行实质性审查。这种情况下直接驳回起诉，可能构成程序违法，因为法院未履行其审理职责。
三、驳回起诉的合法情形
法定驳回起诉情形：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律规定，存在某些法定情形时，法院可以驳回起诉。例如，原告主体不适格、被告不明确、诉讼请求不明确或缺乏事实依据等。
程序合法性审查：
- 即使存在法定驳回起诉的情形，法院也应依法进行程序审查，确保驳回起诉的决定符合法律规定。这包括通知当事人、听取当事人意见、审查证据等程序性事项。
四、具体情形分析
若法院未依法进行审理即驳回起诉：
- 在这种情况下，法院可能未对合同“三性”进行认定，也未提及争议焦点，直接驳回了原告的起诉。这种做法可能构成程序违法，因为法院未履行其审理职责，未就案件进行实质性审查。
若存在法定驳回起诉的情形且法院依法进行了程序审查：
- 在这种情况下，即使法院未对合同“三性”进行详细认定或未明确提及争议焦点，但只要其驳回起诉的决定符合法律规定，且依法进行了程序审查，那么这一决定就是合法的。
五、建议
对于原告：
- 若认为法院驳回起诉的决定违法或不当，可以依法提起上诉或申请再审，要求法院重新审理案件。
对于被告：
- 若认为法院驳回起诉的决定正确且合法，可以积极应诉并准备相关证据和材料，以支持法院的驳回决定。
双方当事人：
- 在诉讼过程中，应积极配合法院的审理工作，提供真实、完整的证据和材料，以便法院能够全面、客观地认定案件事实并作出公正判决。
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