结论：在强拆确认违法且不知具体责任部门的情况下，可以直接起诉区政府，但需满足一定条件。以下从多个角度进行详细分析：
一、起诉区政府的前提条件
区政府是强拆行为的实施者或责任主体：
- 如果区政府直接组织或参与了强拆行为，或者其下属部门在区政府的授权或指示下进行了强拆，那么区政府应被视为责任主体，可以直接起诉。
- 证据收集：需要收集相关证据，如强拆现场的照片、视频、目击者证言、政府文件或公告等，以证明区政府或其下属部门是强拆行为的实施者。
区政府是强拆行为的决策者或批准者：
- 即使强拆行为由具体部门执行，但如果区政府是该行为的决策者或批准者，且该行为违法，那么区政府也应承担相应的法律责任。
- 证据收集：需要获取相关政府文件、会议纪要、审批手续等，以证明区政府在强拆行为中的决策或批准角色。
二、起诉区政府的法律程序
确认强拆行为违法：
- 在起诉区政府之前，需要先通过行政复议或行政诉讼等途径确认强拆行为违法。这是起诉区政府的前提和基础。
- 法律依据：根据《中华人民共和国行政诉讼法》的相关规定，公民、法人或其他组织认为行政机关的行政行为侵犯其合法权益的，有权向人民法院提起诉讼。
提起行政诉讼：
- 在确认强拆行为违法后，可以向有管辖权的人民法院提起行政诉讼，要求区政府承担相应的法律责任，如赔偿损失、恢复原状等。
- 诉讼材料准备：需要准备起诉状、证据材料、身份证明等诉讼材料，并按照法院的要求进行提交。
三、起诉区政府可能面临的挑战及应对
区政府可能提出抗辩：
- 区政府可能会提出抗辩，如强拆行为是合法执行、原告主体不适格、起诉已过诉讼时效等。
- 应对策略：需要针对区政府的抗辩进行充分准备，提供相反证据进行反驳，并依据相关法律法规进行论证。
诉讼风险及成本：
- 起诉区政府可能面临一定的诉讼风险和成本，如诉讼费用、律师费用、时间成本等。
- 风险评估：在起诉前需要进行充分的风险评估，考虑诉讼的可行性和必要性，以及可能面临的诉讼结果和成本。
四、建议与总结
建议：
- 在起诉区政府之前，建议先咨询专业律师，对案件进行全面评估和分析，制定合适的诉讼策略。
- 积极收集相关证据，确保证据的充分性和有效性，以支持自己的诉讼请求。
总结：
- 在强拆确认违法且不知具体责任部门的情况下，可以直接起诉区政府，但需满足区政府是强拆行为的实施者或责任主体、区政府是强拆行为的决策者或批准者等条件。
- 起诉区政府需要遵循一定的法律程序，并可能面临一定的挑战和成本。因此，在起诉前需要进行充分的风险评估和准备。
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