公司负责人指示发货方虚开发票后将发票款给自己，可能涉及虚开增值税专用发票罪或虚开发票罪，同时还可能涉及职务侵占罪或贪污罪（视公司性质而定）。以下从不同角度详细分析：
一、从虚开发票的角度分析
- 虚开增值税专用发票罪
- 如果虚开的是增值税专用发票，根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；虚开的税款数额较大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；虚开的税款数额巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。
- 公司负责人指示发货方虚开增值税专用发票，属于共同犯罪中的主犯或者从犯（视其在犯罪中的作用而定），需要承担相应的刑事责任。这种行为破坏了国家税收征管秩序，导致国家税款流失。
- 虚开发票罪
- 若虚开的是普通发票，根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条之一规定，虚开本法第二百零五条规定以外的其他发票，情节严重的，处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
- 公司负责人同样会因指示虚开普通发票的行为面临刑事处罚，该行为扰乱了市场经济秩序，影响了发票管理的正常进行。
二、从非法占有发票款的角度分析
- 职务侵占罪
- 如果公司是企业等非国有性质，公司负责人利用职务上的便利，将发票款非法占为己有，数额较大的，根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条规定，构成职务侵占罪。处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
- 公司负责人作为公司管理人员，利用发货方虚开发票后将款项据为己有，符合职务侵占罪的构成要件，即利用职务便利、非法占有本单位财物、数额较大。
- 贪污罪
- 若公司是国有公司、企业或者其他国有单位，公司负责人属于国家工作人员，其利用职务上的便利，将发票款非法占为己有，根据《中华人民共和国刑法》第三百八十二条规定，构成贪污罪。处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或者没收财产；数额特别巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金或者没收财产。
- 国家工作人员利用职务之便侵吞公共财物，贪污罪的处罚力度相对较大，体现了对国家工作人员职务行为廉洁性的严格保护。
公司负责人的这种行为还可能面临行政处罚，如税务机关会对其进行罚款、没收违法所得等处罚措施。同时，公司也可能因负责人的违法行为遭受声誉损害、经济赔偿等不利后果。如果遇到此类法律问题，可以直接向我咨询。