国企在建工程转让给政府，在符合相关法律法规和程序的前提下，是合法的。以下从多个角度对此问题进行分析：

一、合法性基础

1. 法律法规依据：

   • 国企作为市场主体，其资产（包括在建工程）的转让需遵循《中华人民共和国企业国有资产法》、《中华人民共和国公司法》以及相关国有资产转让的规章制度。
   • 若在建工程涉及土地使用权，则还需遵循《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规。

2. 政府收购的合法性：

   • 政府作为公共利益的代表，有权在符合法律法规和公共利益需要的前提下，收购国企的在建工程。
   • 政府收购通常需经过严格的决策程序，包括可行性研究、资产评估、公开招标或拍卖等，以确保交易的公平、公正和透明。

二、合法转让的条件

1. 决策程序合规：

   • 国企转让在建工程需经过内部决策程序，如董事会或股东会决议，并报上级主管部门或国有资产监督管理机构批准。
   • 政府收购也需经过相应的决策程序，如政府常务会议审议、财政部门审核等。

2. 资产评估与定价：

   • 在建工程转让前需进行资产评估，以确定合理的转让价格。评估机构应具有相应资质，评估过程应公开透明。
   • 政府收购时，也应以评估结果为依据，确保收购价格的合理性。

3. 公开交易与竞价：

   • 为确保交易的公平性和透明度，国企在建工程的转让通常应通过公开招标、拍卖等方式进行。
   • 政府收购时，也应遵循公开交易的原则，避免暗箱操作。

三、可能存在的法律风险与防范

1. 法律风险：

   • 若转让程序不合规，如未经批准擅自转让、未进行资产评估或评估不实等，可能导致转让行为无效或被撤销。
   • 若政府收购过程中存在利益输送、腐败等违法行为，将承担相应的法律责任。

2. 风险防范：

   • 国企应严格遵守相关法律法规和程序要求，确保转让行为的合法性和合规性。
   • 政府应加强监管力度，对收购过程进行全程监督，确保交易的公平、公正和透明。
   • 双方可聘请专业律师或法律顾问进行法律审查和风险评估，以降低法律风险。

四、实际操作建议

1. 国企方面：

   • 在转让在建工程前，应充分了解相关法律法规和程序要求，确保转让行为的合法性和合规性。
   • 应积极与政府沟通协商，明确转让条件、价格等关键事项，并签订书面转让协议。

2. 政府方面：

   • 在收购国企在建工程时，应严格遵守相关法律法规和程序要求，确保收购行为的合法性和合规性。
   • 应加强对收购过程的监管力度，确保交易的公平、公正和透明。

总结来说，国企在建工程转让给政府在符合相关法律法规和程序的前提下是合法的。双方应严格遵守相关法律法规和程序要求，确保转让行为的合法性和合规性，并加强沟通协商和风险防范工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。