针对员工违规在单位电瓶车充电的处罚，需结合单位规章制度、劳动合同约定及具体违规情节综合判断，常见处理方式如下：

1. 依据单位规章制度处理
   若单位已制定明确的《安全管理制度》或《员工行为规范》，且其中明确规定“禁止在单位内违规充电”及对应处罚措施（如警告、罚款、解除劳动合同等），则单位可依据制度直接处理。
   关键点：制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）、公示或告知员工（如签字确认、邮件通知），否则可能因程序瑕疵导致处罚无效。

2. 依据劳动合同约定处理
   若劳动合同中明确约定“员工违反安全规定，单位有权解除合同”等条款，且违规充电行为属于“严重违反规章制度”的情形（如引发火灾隐患、多次劝阻无效等），单位可依据《劳动合同法》第39条解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
   关键点：需证明违规行为达到“严重”程度（如造成实际损失、存在主观恶意等），否则可能被认定为违法解除。

3. 依据《安全生产法》或消防法规处理
   若违规充电行为违反《安全生产法》或《消防法》（如堵塞消防通道、私拉电线等），单位可要求员工立即整改，并可向消防部门举报，由行政部门对员工或单位处以警告、罚款等行政处罚。
   关键点：单位需配合行政调查，若自身存在管理疏漏（如未提供合规充电设施），也可能被连带处罚。

4. 民事赔偿责任
   若违规充电导致火灾等事故，造成单位或他人财产损失，员工需依据《民法典》第1165条承担侵权赔偿责任，单位可要求员工赔偿实际损失。
   关键点：需证明损失与违规充电行为存在直接因果关系（如火灾鉴定报告）。

建议处理步骤：

1. 固定证据：拍照、录像或书面记录违规行为，要求员工签字确认；
   
2. 依据制度处理：先按内部规定给予警告或罚款，留存处理记录；
   
3. 严重情形解除合同：若多次违规或造成重大隐患，可依法解除劳动合同；
   
4. 报警或诉讼：若造成损失，可报警或通过法院主张赔偿。
   

温馨提示：单位在处罚前需确保程序合法（如通知工会、听取员工申辩），避免因程序瑕疵引发劳动争议。若对具体情节或证据固定有疑问，可直接向我咨询，我会结合案例为您详细分析。