关于“加班计入绩效工资是否合法”的问题，结论前置如下：
一般情况下，加班工资与绩效工资是两个独立的概念，加班工资不应直接计入绩效工资，也不应用绩效工资来支付加班费。这是因为加班工资是劳动者因超出正常工作时间工作而应得的额外报酬，具有法定性和强制性；而绩效工资则是根据劳动者的工作表现发放的奖励性工资，属于正常工资范围外的额外激励。两者在性质、目的和计算方式上均存在显著区别。
在特定情况下，如果劳动合同或集体合同中有明确约定，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，同时确保劳动者的合法权益不受损害，那么加班工资的计算基数可能包含绩效工资的一部分。但这种情况较为特殊，且需要满足一系列条件。
详细分析如下：
一、加班工资与绩效工资的基本定义及区别
- 加班工资：是用人单位安排劳动者在法定标准工作时间以外工作所支付的额外合法报酬。其计算通常基于劳动合同中规定的劳动者所在岗位的工资标准，并乘以相应的加班时间和加班工资倍数。加班工资具有法定性和强制性，是劳动者应得的合法权益。
- 绩效工资：是针对劳动者工作能力的考核所支付的工资，与劳动者的绩效表现直接挂钩。其计算方式根据公司规章制度和绩效考核体系确定，具有较大的主观性和灵活性。绩效工资旨在激励员工提高工作效率和质量，提升企业的整体业绩。
二、加班工资计算基数的确定及绩效工资是否计入
- 劳动合同有明确约定：如果劳动合同明确约定了工资数额，且该数额包含绩效工资部分，并同时约定以此作为加班工资计算基数，那么在这种情况下，绩效工资应计入加班工资计算基数。但需注意，这种约定应确保劳动者不会因此受到不利影响，即加班费的计算基数不得低于正常工资标准。
- 集体合同有约定：若劳动合同未约定，但集体合同中有关于加班工资计算基数的规定，且明确包含绩效工资，则按照集体合同执行。同样，这种约定也应确保劳动者的合法权益不受损害。
- 无明确约定时的处理：当劳动合同和集体合同均未约定加班工资计算基数时，一般按照正常出勤月工资的70%来确定，但不得低于当地最低工资标准。此时，如果绩效工资是劳动者正常工作时间劳动报酬的组成部分，且符合相关法律法规的规定，通常会被考虑计入加班工资计算基数。然而，这并非绝对，还需综合考虑绩效工资的发放形式、性质等因素。例如，对于非与正常工作时间直接关联的绩效工资（如季度或年度绩效奖金），可能不会被计入加班工资计算基数。
三、用绩效工资支付加班费的合法性分析
- 合同有约定且合法的情况：如果劳动合同中有明确约定，将绩效工资的一部分作为加班费的计算基数和支付来源，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，同时用人单位支付的加班费按照法定标准计算，这种情况下可能被视为合法。但这种情况较为特殊，且需要满足一系列条件。
- 合同无约定或违法约定的情况：如果劳动合同中没有事先约定绩效工资与加班费的关系，用人单位擅自将绩效工资用于支付加班费，这种做法是不合法的。同样，即使合同有约定，但如果将绩效工资作为加班费计算基数导致计算出的加班费低于按照正常工资标准计算的法定加班费数额，也是不合法的。此外，用人单位不能通过不合理地克扣绩效工资来冲抵加班费，或者在支付加班费后大幅降低绩效评价从而减少绩效工资，这同样是不合法的。
四、法律依据及建议
- 法律依据：根据《劳动法》及《工资支付暂行规定》的相关规定，加班费作为劳动者额外劳动支出的补偿，与绩效工资的性质截然不同。因此，将绩效工资作为加班费支付，实际上是剥夺了劳动者应得的合法权益，违反了劳动法的相关规定。
- 建议：用人单位应严格遵守劳动法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。在实际操作中，应避免将绩效工资与加班费混同使用，而应按照法律规定的标准和方式支付加班费。同时，建议劳动者在签订劳动合同时，仔细审查合同条款，确保自己的权益得到充分保护。如果遇到用人单位将加班计入绩效工资或用绩效工资支付加班费的情况，劳动者有权向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
总结：加班工资与绩效工资是两个独立且不同的工资组成部分。在大多数情况下，加班工资不应直接计入绩效工资，也不应用绩效工资来支付加班费。然而，在具体案件中，还需根据劳动合同、集体合同及绩效工资的发放形式、性质等因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。