合同可以有两个乙方，法律上对此并无禁止性规定。在合同中设置多个乙方是完全可行的，只要合同内容明确、条款清晰，且各方对合同条款均无异议，合同即具有法律效力。以下是对这一问题的详细解答，包括开发票的相关事宜：

1. 合同设置多个乙方的法律基础：

   • 合同是双方或多方之间设立、变更、终止民事关系的协议。只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且各方意思表示真实，合同即有效。
   • 在合同中设置多个乙方，意味着多个主体共同作为合同的一方，承担合同约定的权利和义务。这种设置方式在商业合作中并不罕见，如联合开发、共同承包等场景。

2. 开发票的相关事宜：

   • 发票开具主体：发票应由实际提供商品或服务的主体开具。如果两个乙方共同提供了商品或服务，且难以区分各自提供的部分，可以协商确定由其中一个乙方作为发票开具方，或者在合同中明确约定发票的开具方式和比例。
   • 发票内容：发票内容应准确反映实际提供的商品或服务。如果两个乙方分别提供了不同的商品或服务，应分别开具发票，并在发票上注明相应的商品或服务名称、数量、金额等信息。
   • 税务处理：两个乙方应各自按照税法规定申报纳税。如果发票由其中一个乙方开具，开具方应确保发票的真实性和合法性，并承担相应的税务责任。同时，接收发票方也有权要求开具方提供合法有效的发票。

3. 合同设置多个乙方的注意事项：

   • 明确各方权利和义务：在合同中应明确约定两个乙方的权利和义务，包括各自提供的商品或服务范围、质量标准、付款方式、违约责任等。
   • 协商一致：两个乙方应就合同条款进行充分协商，确保各方对合同内容均无异议。如有必要，可以签订补充协议或附件，对合同条款进行进一步细化和明确。
   • 法律审查：在签订合同前，建议对合同内容进行法律审查，确保合同条款的合法性和有效性。如有需要，可以聘请专业律师进行协助。

总结与建议：合同可以有两个乙方，且法律上对此并无禁止性规定。在设置多个乙方时，应明确各方的权利和义务，协商一致并签订合法有效的合同。关于开发票的问题，应根据实际提供的商品或服务情况确定发票开具主体和内容，并确保发票的真实性和合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。