结论前置：周六不上班是否扣全勤工资，这主要取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度与劳动合同的约定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位有权根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。这意味着，公司有权在规章制度中规定全勤工资的发放条件，包括是否要求员工周六上班。
- 如果公司的规章制度或劳动合同中明确规定了全勤工资的发放条件，且该条件包括要求员工周六上班，那么员工未周六上班，公司有权根据规定扣除全勤工资。
- 反之，如果公司的规章制度或劳动合同中没有此类规定，或者规定与劳动法相冲突（如要求员工无偿加班），则公司不能随意扣除全勤工资。
加班与全勤工资的关系：
- 加班是指员工在正常工作时间之外，按照公司的要求继续工作。根据《劳动法》的规定，加班应当支付加班费，且加班时间受到严格限制。
- 全勤工资通常是对员工在正常工作时间内全勤出勤的奖励。如果公司要求员工周六上班，并视为正常工作时间的一部分，那么员工周六上班应当获得相应的工资报酬，但这并不直接等同于全勤工资。全勤工资的发放仍应依据公司的规章制度和劳动合同的约定。
- 如果公司未将周六上班视为正常工作时间，而是要求员工无偿加班，那么这种做法可能违反《劳动法》的规定，员工有权拒绝并可以向劳动监察部门投诉。
实际操作建议：
- 对于员工而言，首先应当仔细阅读公司的规章制度和劳动合同，了解全勤工资的发放条件和加班政策。
- 如果对公司的规定有疑问或不满，可以与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，寻求合理的解释或调整。
- 如果公司违反了《劳动法》的规定，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，维护自己的合法权益。
举例说明：假设某公司的规章制度中规定，全勤工资的发放条件是员工在一个月内无迟到、早退、旷工等行为，且每周工作五天，每天八小时。那么，如果员工周六未上班，但满足了其他全勤条件，公司就不应扣除全勤工资。反之，如果公司的规章制度中明确规定了全勤工资的发放需要包括周六上班，那么员工未周六上班，公司就有权扣除全勤工资。
法律背景与建议：在处理此类问题时，建议员工和公司都应当遵循《劳动法》的相关规定，确保劳动关系的和谐稳定。如果遇到纠纷或疑问，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。