针对您提出的“农民挂靠单位已经退休怎么办”的问题，首先需要明确的是，“挂靠”单位代缴社保费是违法行为，这种行为不仅违反了《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，还可能对您的个人权益造成严重影响。
一、挂靠参保的违法性
根据《中华人民共和国社会保险法》的规定，社会保险费缴纳的法定单位主体是用人单位，即与劳动者建立劳动关系的是用人单位。而“挂靠”参保，即委托中介冒充用人单位缴费，这种行为是不合法的。它虚构了劳动关系，骗取了社会保险待遇，属于欺诈行为。
二、挂靠参保的后果
法律责任：根据相关法律规定，以欺诈、伪造证明材料或者其他手段骗取社会保险待遇的，由社会保险行政部门责令退回骗取的社会保险金，并处以罚款。情节严重的，还可能构成诈骗罪，面临刑事处罚。
权益受损：由于中介机构与参保人并不存在真实的劳动关系，代缴社保的单位和缴费基数等信息都是虚构的。这将对参保人养老保险、失业保险、工伤保险等待遇的申领造成影响，您可能无法享受对应的待遇。
经济损失：存在挂靠单位可能钱拿走了，实际并没有帮参保人缴费的情况，这将给参保人造成经济损失。
三、已经退休的处理方式
如果您已经通过挂靠单位办理了退休手续并领取了养老待遇，但这一行为被查实为违法，那么您可能会面临以下处理：
清退参保缴费记录：社会保险行政部门将依法清退您的参保缴费记录，这意味着您之前的缴费可能被视为无效。
取消退休资格：如果您已经领取了养老待遇，相关部门可能会报请社会保险行政部门取消您的退休资格，并追回全部违规领取的养老待遇。
法律责任追究：根据违法情节的严重程度，您可能还需要承担相应的法律责任，包括行政处罚和刑事处罚。
四、建议
立即停止违法行为：如果您目前仍在通过挂靠单位缴纳社保费，请立即停止这一行为，并尽快与真实用人单位建立劳动关系，依法缴纳社保费。
咨询相关部门：如果您对已经办理的退休手续或领取的养老待遇存在疑问，建议咨询当地社会保险行政部门或人力资源社会保障部门，了解具体情况并寻求解决方案。
保护个人权益：在处理此类问题时，请务必保护好自己的个人权益，避免受到不法中介的欺骗和侵害。
总之，“挂靠”参保是违法行为，不仅无法保障您的个人权益，还可能让您面临法律责任和经济损失。因此，建议您依法参保、依法退休，确保自己的权益得到合法保障。