结论：针对你辞工后老板扣了1000元且劳动仲裁不受理的情况，你可以先确认仲裁不受理的原因，再根据不同情况采取相应措施，包括向法院起诉、向劳动监察部门投诉或寻求其他合法途径解决。

分析：

1. 确认仲裁不受理的原因：

   • 劳动仲裁不受理可能有多种原因，比如你的仲裁请求不属于劳动争议仲裁的受案范围、仲裁申请超过了时效期限、仲裁申请材料不齐全或不符合要求等。你需要仔细阅读仲裁机构出具的不受理通知书，了解具体原因。

2. 根据不受理原因采取相应措施：

   • 若不属于受案范围：你需要确认你的诉求是否确实属于劳动争议范畴。如果老板扣钱的行为涉及违法扣除工资、未支付加班费等劳动争议事项，理论上应属于仲裁受案范围。若仲裁机构认为不属于，你可以进一步咨询专业律师，确认你的诉求是否可以通过其他法律途径解决，比如直接向法院起诉。
   • 若超过时效期限：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从你知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。如果你确实超过了时效期限，且没有不可抗力或其他正当理由，那么仲裁机构可能不会受理。但你可以尝试与老板协商解决，或者向劳动监察部门投诉，看是否能通过行政手段追回被扣的钱。
   • 若申请材料不齐全或不符合要求：你可以根据仲裁机构的要求，补充完善申请材料后重新申请仲裁。

3. 向法院起诉：

   • 如果仲裁机构不受理你的申请，且你认为你的诉求合理合法，你可以直接向有管辖权的人民法院提起诉讼。在起诉前，你需要准备好相关证据材料，如劳动合同、工资条、扣钱通知等，以证明老板扣钱的行为违法。

4. 向劳动监察部门投诉：

   • 你还可以向当地的劳动监察部门投诉老板的违法行为。劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查处理，并可以责令用人单位改正违法行为、支付被扣的工资等。

5. 寻求其他合法途径：

   • 除了仲裁和诉讼外，你还可以尝试通过调解、协商等方式解决与老板的纠纷。如果双方能够达成一致意见，可以签订书面协议并履行。

建议：

• 在处理此类纠纷时，务必保持冷静和理性，不要采取过激行为。
• 尽可能收集并保存好相关证据材料，以便在需要时证明自己的权益。
• 如果对法律程序不熟悉或感到困惑，可以及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议和帮助。