结论前置：若小老板以公司扣钱为理由扣员工工资，且劳动仲裁未予处理，员工可以通过多种途径来维护自己的合法权益。以下是一些具体的分析和建议：
一、核实劳动仲裁未处理的原因
- 程序问题：首先，需要确认劳动仲裁是否因程序问题（如超过仲裁时效、证据不足等）而未予处理。如果是程序问题，员工可以了解具体原因，并在必要时补充证据或重新申请仲裁。
- 实体问题：如果劳动仲裁认为扣工资行为合法或存在争议，也可能导致未予处理。此时，员工需要仔细分析仲裁机构的理由，并考虑是否通过法律途径进一步维权。
二、法律途径维权
提起诉讼：
- 如果劳动仲裁未予处理或员工对仲裁结果不满，可以向人民法院提起诉讼。
- 在诉讼过程中，员工需要提供充分的证据证明小老板扣工资的行为违法，如劳动合同、工资条、扣款通知等。
- 法院将根据事实和法律规定，判断扣工资行为是否合法，并作出相应的判决。
申请劳动监察：
- 员工还可以向当地劳动监察部门投诉，要求其对小老板的扣工资行为进行调查和处理。
- 劳动监察部门有权对违法行为进行处罚，并责令小老板补发工资。
三、具体法律分析
扣工资的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位不得无故扣减劳动者工资。
- 如果小老板以公司扣钱为理由扣员工工资，且该理由不合法或未得到员工同意，则构成违法行为。
劳动仲裁的受理范围：
- 劳动仲裁主要受理因劳动报酬、工伤医疗费、经济补偿或者赔偿金等发生的争议。
- 如果员工认为小老板扣工资的行为属于上述争议范围，且符合仲裁条件，劳动仲裁机构应当受理。
- 若未受理，员工有权要求仲裁机构说明理由，并在必要时采取其他法律途径。
四、建议与注意事项
- 保留证据：员工应妥善保留与扣工资相关的所有证据，如劳动合同、工资条、扣款通知、沟通记录等。这些证据在维权过程中将起到关键作用。
- 及时行动：一旦发现小老板扣工资的行为，员工应及时采取行动，避免超过仲裁时效或诉讼时效。
- 寻求专业帮助：如果员工对法律程序不熟悉或感到困惑，可以寻求专业律师的帮助。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助员工更好地维护自己的合法权益。
最后，如果小老板以公司扣钱为理由扣员工工资且劳动仲裁未予处理，员工不要气馁。通过核实原因、采取法律途径维权、保留证据并及时行动，员工仍然有机会维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。