转让协议被判无效后，确实可以起诉要求确认不存在转让行为。以下从几个方面为你详细分析：
一、法律基础与逻辑
合同无效的法律后果：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无效的合同自始没有法律约束力。这意味着，一旦转让协议被判定为无效，该协议在法律上就被视为从未存在过，对双方均不产生法律效力。
确认不存在转让行为的请求权基础：由于无效合同自始无效，因此，基于该无效合同所进行的转让行为在法律上也是无效的。当事人有权请求法院确认不存在该转让行为，以恢复至合同签订前的法律状态。
二、实际操作与诉讼策略
提起确认之诉：在转让协议被判无效后，如果双方对转让行为的效力存在争议，或者一方试图依据无效的转让协议主张权利，另一方可以提起确认之诉，请求法院确认不存在该转让行为。
证据准备：在提起确认之诉时，需要准备充分的证据来证明转让协议的无效性以及转让行为的不存在。这些证据可能包括转让协议本身、法院关于转让协议无效的判决书、相关交易记录、证人证言等。
诉讼风险与应对：虽然转让协议被判无效后提起确认之诉在法律上是可行的，但诉讼过程中仍存在一定的风险。例如，对方可能提出抗辩或反诉，试图证明转让行为的效力或主张其他权利。因此，在提起诉讼前，应充分评估诉讼风险，并制定相应的应对策略。
三、可能遇到的法律问题与解决
诉讼时效问题：在提起确认之诉时，需要注意诉讼时效的问题。如果超过了法定的诉讼时效期间，法院可能会驳回起诉。因此，在发现转让协议无效后，应及时采取法律措施，避免超过诉讼时效。
与其他法律关系的交织：在某些情况下，转让行为可能与其他法律关系（如担保、抵押等）交织在一起。在提起确认之诉时，需要妥善处理这些法律关系，避免引发新的法律纠纷。
四、建议与总结
及时咨询专业律师：在转让协议被判无效后，如果考虑提起确认之诉，建议及时咨询专业律师，了解具体的法律程序和诉讼策略。
全面评估法律风险：在提起诉讼前，应全面评估法律风险，包括诉讼时效、证据准备、对方可能的抗辩等，以确保诉讼的顺利进行。
维护自身合法权益：通过提起确认之诉，可以维护自身的合法权益，避免因无效的转让协议而遭受不必要的损失。
综上所述，转让协议被判无效后，确实可以起诉要求确认不存在转让行为。但在实际操作过程中，需要注意法律程序和诉讼策略，以确保诉讼的顺利进行和自身合法权益的维护。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。