在解答您的问题“同居关系可以在起诉抚养费纠纷时同时解除吗”之前，我们首先要明确的是，同居关系的解除与子女抚养费纠纷的解决是两个相对独立但又可能相互关联的法律问题。
关于同居关系的解除：
同居关系本身并不受法律特别保护，其解除通常不需要通过法律程序来“正式”结束，除非涉及到财产分割、子女抚养等具体法律问题时，才可能需要通过诉讼或协商等方式来解决。在大多数情况下，同居关系的双方可以自行协商结束同居状态，无需法院介入。
关于子女抚养费纠纷的诉讼：
当同居关系中的双方有子女，且因抚养费问题产生纠纷时，这确实是一个可以通过法律途径解决的问题。此时，任何一方都可以向法院提起诉讼，要求对方支付或增加抚养费。
关于同时解除同居关系与解决抚养费纠纷：
法律程序上：虽然同居关系的解除本身不需要法律程序，但在提起抚养费纠纷诉讼时，你可以在诉讼请求中提及同居关系的现状（即已解除或即将解除），但这并不意味着法院会“正式”宣告同居关系的解除。法院的主要关注点在于解决抚养费纠纷，确保子女的合法权益得到保障。
实际操作中：在提起抚养费纠纷诉讼时，你可以将同居关系的解除作为背景信息提供给法院，以帮助法院更好地理解案件的全貌。然而，这并不改变抚养费纠纷诉讼的本质和目的。
建议：如果你希望在解决抚养费纠纷的同时，也明确同居关系的状态（尽管这在法律上可能不是必需的），你可以在起诉状中详细阐述同居关系的现状，并请求法院在判决中对此进行说明（尽管这种说明可能不具有法律上的“解除”效力）。但更重要的是，你要确保抚养费纠纷的诉讼请求明确、具体，并提供充分的证据来支持你的主张。
总结：
在起诉抚养费纠纷时，你无法通过法律程序“正式”解除同居关系（因为同居关系本身不需要法律程序来解除），但你可以在诉讼请求中提及同居关系的现状，并请求法院在判决中对此进行说明。更重要的是，你要专注于解决抚养费纠纷，确保子女的合法权益得到充分保障。如果你需要进一步的法律帮助或建议，我建议你咨询专业的律师或法律机构。