结论：公司周日上班但不算加班，要用法定节假日来调休的做法，并不完全合法，具体需分情况讨论。
分析：
周末加班与调休的基本原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这表明，周末加班时，用人单位应首先考虑安排调休；若无法安排调休，则必须支付加班工资。
公司用法定节假日调休的合法性：
- 若公司周日安排加班，并计划用法定节假日来调休：这种做法通常是不合法的。因为法定节假日是劳动者的法定休息日，用人单位无权单方面决定用法定节假日来调休周末的加班。法定节假日的休息权是劳动者的基本权益，不能被随意剥夺或替代。
- 若公司周日安排加班，并已与劳动者协商一致用法定节假日调休：在极少数特殊情况下，如果用人单位与劳动者经过充分协商，且劳动者自愿同意用法定节假日来调休周末的加班，这种做法可能在一定程度上被视为合法。但这种情况非常罕见，且需要满足严格的协商一致和自愿原则。
劳动者的权益保护：
- 劳动者有权拒绝公司用法定节假日调休周末加班的要求，并要求公司按照法律规定支付加班工资或安排补休。
- 如果公司坚持用法定节假日调休，且未与劳动者协商一致，劳动者可以向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
建议：
- 对于劳动者：如果公司提出用法定节假日调休周末加班的要求，应首先与公司进行沟通协商，明确自己的权益和立场。如果沟通无果，可以寻求法律援助或向相关部门投诉。
- 对于用人单位：应遵守相关法律法规，尊重劳动者的合法权益。在安排加班时，应优先考虑安排补休或支付加班工资，而不是单方面决定用法定节假日来调休。
可能后果：
- 如果公司违法用法定节假日调休周末加班，且未支付加班工资或安排补休，可能面临劳动监察部门的处罚和劳动者的法律诉讼。
- 劳动者如果因公司违法调休而遭受损失（如无法享受法定节假日的休息、无法获得加班工资等），有权要求公司进行赔偿。
总之，公司周日上班但不算加班，要用法定节假日来调休的做法并不完全合法。劳动者应了解自己的权益和义务，积极维护自己的合法权益；用人单位也应遵守相关法律法规，合理安排工作时间和休息时间。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。