工厂在发生工伤后扣除个人绩效工资，这一行为通常是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：

法律背景

根据《工伤保险条例》以及相关劳动法律法规，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”通常包括职工的基本工资、绩效工资、奖金、津贴等。因此，工厂在职工工伤停工留薪期间扣除绩效工资，违反了上述规定。

工厂可能的行为分析

1. 合法情形（极少见）：

   • 如果工厂能够证明职工的绩效工资与实际工作成果直接相关，且职工在工伤期间确实没有完成相应的工作任务或成果，理论上工厂可以按照实际工作成果调整绩效工资。但在实际操作中，由于工伤职工在停工留薪期内通常无法正常工作，因此这种情形极为少见，且需要工厂提供充分的证据来支持其调整绩效工资的决定。

2. 非法情形（常见）：

   • 工厂在职工工伤停工留薪期间，无正当理由扣除绩效工资，或者以工伤为由降低职工的整体工资待遇，这种行为是违法的。职工有权要求工厂补发被扣除的绩效工资，并可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

法律建议

1. 与工厂协商：

   • 首先，你可以尝试与工厂进行协商，明确表达你的诉求和法律依据，要求工厂补发被扣除的绩效工资。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门有权对工厂的违法行为进行调查和处理。

3. 申请劳动仲裁：

   • 你还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，你需要提供相关的证据材料，如工伤认定书、工资单、劳动合同等。

可能的法律后果

如果工厂被认定存在违法行为，除了需要补发被扣除的绩效工资外，还可能面临劳动监察部门的处罚，如罚款、责令改正等。同时，工厂的违法行为还可能影响其声誉和信誉，对未来的招聘和用工产生不利影响。

综上所述，工厂在发生工伤后扣除个人绩效工资的行为通常是不合法的。如果你遇到了这种情况，建议及时与工厂协商或寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。