结论：工厂搬迁员工不愿去新厂，工厂只给员工留原厂并支付基本工资的做法是否合法及员工应如何应对，需分情况讨论。
若工厂搬迁属于劳动合同的重大变更：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则。工厂搬迁，尤其是跨地区或较大距离的搬迁，往往被视为劳动合同的重大变更，因为它可能影响到员工的工作地点、生活环境等关键条件。
- 在这种情况下，工厂不能单方面决定只给员工留原厂并支付基本工资。工厂应当与员工进行协商，就工作地点、工资待遇等关键条款达成新的协议。如果员工不同意变更，工厂不能强制执行，而应当按照法律规定给予相应的经济补偿，并依法解除劳动合同。
若工厂搬迁不属于劳动合同的重大变更，或员工同意留原厂工作：
- 如果工厂搬迁对员工的工作地点、生活环境等影响较小，或者员工同意留原厂工作，那么工厂给员工留原厂并支付基本工资的做法可能并不违法。但这里的关键是“基本工资”是否满足当地最低工资标准，以及是否符合劳动合同中的约定。
- 如果基本工资低于当地最低工资标准，或者低于劳动合同中的约定，那么工厂的做法就是违法的。员工有权要求工厂按照法律规定或劳动合同约定支付工资。
员工应如何应对：
- 与工厂协商：员工首先可以尝试与工厂进行协商，就工作地点、工资待遇等关键条款达成新的协议。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门对工厂的违法行为进行调查和处理。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动监察部门的处理结果不能满足员工的需求，员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
建议：在处理此类问题时，员工应当保留好相关的证据，如劳动合同、工资单、工厂搬迁的通知等，以便在需要时证明自己的权益。同时，员工也可以寻求法律援助或咨询专业律师，以更好地维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。