结论：综合工时制下多加了五分钟是否违法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 综合工时制的定义与特点：

   • 综合计算工时工作制是指用人单位因行业特点或受季节等自然条件限制，需要安排劳动者连续作业，采取在一定周期内（如周、月、季、年）综合计算工作时间的工时制度。
   • 在这种制度下，劳动者的工作时间并非固定每日8小时，而是在一定周期内综合计算，只要总工作时间不超过法定标准，即不视为违法。

2. 多加五分钟是否违法的判断标准：

   • 周期内总工作时间：首先，需要查看劳动者在一个综合计算周期内（如一个月）的总工作时间是否超过了法定标准工作时间（如每月176小时，根据月均工作日21.75天和每日8小时计算得出，但具体可能因地区和行业而异）。如果总工作时间未超标，那么即使某天多加了五分钟，也不构成违法。
   • 加班工资支付：如果多加的五分钟导致劳动者在某个工作日的工作时间超过了8小时，且这部分时间被认定为加班，那么用人单位应当按照法律规定支付加班工资。根据《山东省企业工资支付规定》等相关法规，加班工资的计算基数应为劳动者本人上月扣除加班工资后的应发工资数额，且加班工资的支付比例需符合法定标准（如工作日加班不低于工资的150%）。

3. 可能存在的法律后果：

   • 如果违法：如果用人单位未按照法律规定支付加班工资，或者在一个综合计算周期内总工作时间超过了法定标准，那么劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求用人单位支付加班工资、经济补偿等。
   • 如果不违法：如果多加的五分钟并未导致总工作时间超标，且用人单位已按照法律规定支付了加班工资（如果适用），那么这种行为不构成违法，劳动者无权要求额外补偿。

4. 建议与注意事项：

   • 保留证据：劳动者应保留好与工作时间、加班工资支付相关的证据，如考勤记录、工资条等，以便在需要时证明自己的权益。
   • 及时沟通：如果劳动者对工作时间或加班工资有疑问，应及时与用人单位沟通，要求用人单位提供明确的解释和计算依据。
   • 寻求法律帮助：如果劳动者认为自己的权益受到了侵害，且无法与用人单位协商解决，可以寻求法律帮助，向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

总结：综合工时制下多加了五分钟是否违法，取决于一个综合计算周期内总工作时间是否超标以及加班工资是否依法支付。劳动者应了解自己的权益和法律规定，及时保留证据并寻求法律帮助，以维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。