案件中止调查的依据主要来源于相关的法律法规，具体情形和法律依据如下：
《公安机关办理刑事案件程序规定》的相关规定：
- 虽然该规定中并未直接使用“中止调查”或“中止侦查”的表述，但明确规定了在某些特定情况下，侦查活动应当中止。例如，根据《公安机关办理刑事案件程序规定》第二百六十四条，在侦查过程中，若犯罪嫌疑人长期潜逃或患有精神病等严重疾病不能接受讯问，应当中止侦查。中止侦查的原因消失后，应恢复侦查。这一规定实际上为案件中止调查提供了法律依据，即当出现犯罪嫌疑人长期潜逃或患有严重疾病等情形时，可以中止调查。
《人民检察院刑事诉讼规则》的相关规定：
- 《人民检察院刑事诉讼规则》第二百五十六条明确规定，人民检察院直接受理侦查的案件，在侦查过程中若犯罪嫌疑人长期潜逃或患有精神病等严重疾病，经检察长批准，可以中止侦查。中止侦查的原因消失后，同样需经检察长批准恢复侦查。这一规定直接明确了人民检察院在办理刑事案件时，可以依据特定情形中止侦查，也为案件中止调查提供了直接的法律依据。
中止调查的具体情形：
- 犯罪嫌疑人长期潜逃：当犯罪嫌疑人长期潜逃，且采取有效追捕措施仍不能缉拿归案时，可以中止调查。这是因为继续调查可能无法取得实质性进展，且会浪费司法资源。
- 犯罪嫌疑人患有严重疾病：当犯罪嫌疑人患有精神病等严重疾病不能接受讯问，丧失诉讼行为能力时，也可以中止调查。这是为了保障犯罪嫌疑人的合法权益，避免在其无法理解诉讼程序的情况下进行调查。
中止调查期间的处理：
- 在中止调查期间，若犯罪嫌疑人在押，应根据具体情况依法处理。例如，对符合延长侦查羁押期限条件的，应当依法延长侦查羁押期限；对侦查羁押期限届满的，应当依法变更为取保候审或者监视居住措施。
中止调查的意义：
- 中止调查制度的设立，既体现了法律的严谨性和公正性，也充分考虑了实际操作的灵活性和人性化。它确保了调查活动在面对复杂情况时能够依法、有序地进行，同时保障了犯罪嫌疑人的合法权益不受侵犯。通过中止调查，司法机关可以在尊重法律的前提下，更加合理地分配资源，提高办案效率，维护司法公正和法律秩序。
总结与建议：
- 案件中止调查是一项重要的法律制度，其法律依据明确，具体情形清晰，处理程序规范。在实际应用中，司法机关应严格遵循相关法律法规，确保中止调查制度的正确实施。
- 如果您或您身边的人遇到案件中止调查的情况，且对中止调查的依据、程序或后续处理有疑问，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，提供详细的法律解释和专业的法律建议。