结论前置：店长不能胜任职务时，公司不能直接将其降为员工，而需遵循一定的法律程序和规定。

详细分析：

1. 劳动合同与岗位变更：

   • 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同一旦签订，双方应严格履行，包括工作岗位、工作内容等条款。
   • 若公司想要变更店长的工作岗位，即将其降为员工，这实际上是对劳动合同内容的重大变更。根据法律规定，这种变更需要双方协商一致，并签订书面变更协议。如果店长不同意变更，公司不能单方面强制执行。

2. 不能胜任工作的处理：

   • 如果店长确实不能胜任工作，公司不能直接降职，但可以依据《劳动合同法》的相关规定，对店长进行培训或者调整工作岗位。这是公司的合法权利，但同样需要遵循一定的程序，如与店长进行沟通、提供培训机会、协商调整岗位等。
   • 如果经过培训或者调整工作岗位后，店长仍然不能胜任工作，公司可以提前三十日以书面形式通知店长本人，或者额外支付店长一个月工资后，解除劳动合同。但这一过程中，公司需要确保程序的合法性和公正性，避免侵犯店长的合法权益。

3. 降职的合法性与合理性：

   • 降职作为一种对员工的处罚措施，必须基于合法、合理的理由。如果公司仅仅因为店长不能胜任工作就直接降职，而没有提供充分的证据和合理的解释，这种降职行为可能被视为违法或不合理。
   • 此外，降职还可能涉及员工的尊严和职业发展，因此公司在做出降职决定时，应充分考虑员工的感受和利益，避免对员工造成不必要的伤害。

4. 法律建议：

   • 对于公司而言，如果店长不能胜任工作，应首先与店长进行沟通，了解其原因和困难，尝试提供培训或调整岗位等解决方案。如果确实需要降职或解除劳动合同，应确保程序的合法性和公正性，避免引发劳动纠纷。
   • 对于店长而言，如果面临降职或解除劳动合同的情况，应了解自己的合法权益和维权途径。如果认为公司的决定不合法或不合理，可以通过劳动仲裁或诉讼等方式维护自己的权益。

可能后果：

• 如果公司未经协商一致就单方面降职店长，店长有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司恢复原岗位或支付相应的赔偿。
• 如果公司降职行为被认定为违法或不合理，还可能面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。

总结与建议：店长不能胜任职务时，公司不能直接将其降为员工。公司应遵循法律程序和规定，与店长进行沟通协商，提供培训或调整岗位等解决方案。如果确实需要降职或解除劳动合同，应确保程序的合法性和公正性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。