针对您提出的“合同约定两个仲裁委管辖，但起诉到法院如何处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、合同约定仲裁管辖的基本原则
首先，需要明确的是，仲裁机构的管辖权来源于双方有效的仲裁协议。若合同中明确约定了两个仲裁委员会作为争议解决机构，这本身在形式上可能构成约定不明确，因为通常仲裁协议应明确指向一个具体的仲裁机构。然而，若双方确实有此约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，理论上双方仍有通过仲裁解决争议的可能性，但实际操作中可能会面临诸多困难。
二、起诉到法院后的处理方式
法院审查仲裁协议的有效性：
- 当您将争议起诉到法院时，法院会首先审查合同中是否存在有效的仲裁协议。若发现合同中约定了两个仲裁委员会，且未明确哪一个具有最终管辖权，法院可能会认为该仲裁协议约定不明确，从而认定不存在有效的仲裁协议。
法院获得管辖权：
- 在认定不存在有效仲裁协议的情况下，法院将获得对案件的管辖权，并依法进行审理。此时，您无需再担心仲裁机构与法院之间的管辖权冲突问题。
被告提出管辖权异议的情况：
- 若被告认为仲裁更有利，可能会在首次开庭前提出管辖权异议，主张应通过仲裁解决争议。但如前所述，若仲裁协议约定不明确，法院将驳回被告的异议，并继续审理案件。
三、实际操作中的建议
仔细审查合同条款：
- 在起诉前，您应仔细审查合同中的仲裁条款，确认是否存在两个仲裁委员会的约定，以及该约定是否明确、有效。若约定不明确，建议您考虑通过诉讼方式解决争议。
咨询法律专业人士：
- 鉴于仲裁协议的有效性和管辖权问题可能涉及复杂的法律判断，我建议您及时咨询法律专业人士的意见。他们可以根据您的具体情况，为您提供准确的法律指导和建议。
准备充分的证据材料：
- 无论选择诉讼还是仲裁，您都需要准备充分的证据材料来支持自己的主张。因此，在起诉前，您应收集、整理相关证据，确保在诉讼过程中能够充分展示自己的权益。
遵循法律程序：
- 在诉讼过程中，您应严格遵循法律程序，确保起诉的合法性和有效性。同时，也应注意保护自己的合法权益，避免因程序问题而影响案件的实体审理。
四、特殊情况的处理
- 若您确实希望通过仲裁解决争议，但合同中的仲裁协议约定不明确，您可以尝试与被告协商，达成一个明确的仲裁协议。若协商无果，您也可以考虑通过诉讼方式解决争议，并在诉讼过程中提出相关主张。
综上所述，当合同中约定了两个仲裁委员会管辖时，起诉到法院后，法院将审查仲裁协议的有效性。若认定不存在有效仲裁协议，法院将获得管辖权并依法审理案件。在实际操作中，我建议您仔细审查合同条款、咨询法律专业人士、准备充分的证据材料，并遵循法律程序以确保诉讼的顺利进行。