公司文员擅自删除公司档案文件，这一行为是否违法，需根据具体情况来判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从民事法律关系的角度：

   • 公司档案文件通常属于公司的财产，且往往包含重要的商业信息、客户资料、合同文件等，具有极高的经济价值。
   • 文员作为公司员工，有义务妥善保管公司财产，包括档案文件。擅自删除这些文件，可能构成对公司财产权的侵害，公司有权要求文员承担民事赔偿责任，如恢复文件、赔偿损失等。

2. 从劳动法律关系的角度：

   • 如果文员的行为严重违反了公司的规章制度或劳动合同中的约定，公司有权依据相关法律法规和内部规定，对文员进行纪律处分，甚至解除劳动合同。
   • 例如，若公司规章制度中明确规定了禁止擅自删除公司档案文件，并规定了相应的处罚措施，那么文员的行为就可能构成严重违纪，公司有权依据规定进行处理。

3. 从刑事法律关系的角度（在特定情况下）：

   • 如果文员删除的文件涉及公司的重要商业秘密或国家秘密，且其明知这一点而故意删除，那么该行为可能构成犯罪。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，故意泄露国家秘密罪或侵犯商业秘密罪等，都可能适用于此类情况。但需要注意的是，这通常要求文件具有极高的秘密性，且文员的行为具有故意性。

4. 实际建议：

   • 对于公司而言，应建立健全的档案管理制度，明确档案文件的保管、使用和销毁程序，以及违反规定的处罚措施。
   • 对于文员而言，应严格遵守公司的规章制度和劳动合同约定，妥善保管公司档案文件，避免擅自删除或泄露。
   • 如果发生此类事件，公司应及时采取措施，如恢复文件、调查原因、追究责任等，并考虑是否需要向公安机关报案或寻求法律援助。

总结来说，公司文员擅自删除公司档案文件的行为，在民事上可能构成对公司财产权的侵害，在劳动上可能构成严重违纪，在特定情况下还可能构成犯罪。因此，建议公司加强档案管理，文员严格遵守规定，以避免不必要的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。