结论：双方已经结算但约定等对方可以开票再付款的，权利义务并不一定在结算当日终止，这主要取决于双方的具体约定以及相关法律法规的规定。

分析如下：

1. 合同约定的效力：

   • 双方在合同中明确约定了结算后需等待对方开票再付款的条款，这一约定是双方真实意思的表示，且不违反法律法规的强制性规定，因此具有法律效力。
   • 在此情况下，即使双方已经进行了结算，但付款义务并未立即产生，而是需要等待对方开票后才能履行。因此，权利义务并未在结算当日完全终止。

2. 法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，合同的履行应当遵循诚实信用原则，按照约定全面履行自己的义务。
   • 如果合同中明确约定了付款条件（如开票后付款），则付款方有权在条件成就前拒绝付款，且不构成违约。

3. 可能的风险与应对：

   • 风险：如果开票方迟迟不开票，可能导致付款方无法及时履行付款义务，进而可能引发合同纠纷。
   • 应对：双方可以在合同中明确约定开票的时间、方式以及违约责任等条款，以降低风险。同时，付款方也可以定期与开票方沟通，了解开票进度，确保合同顺利履行。

4. 特殊情况下的权利义务终止：

   • 如果双方在结算后，通过协商一致解除了合同或者变更了合同中的付款条款，那么权利义务可能会在结算当日或协商确定的日期终止。
   • 另外，如果合同中存在法定解除事由（如不可抗力导致合同无法履行等），双方也可以依法解除合同，导致权利义务终止。

建议：

• 双方在签订合同时，应当明确约定结算、开票和付款等条款，以避免后续产生纠纷。
• 如果已经发生了类似情况，双方应当积极沟通协商，寻求解决方案。如果协商无果，可以考虑通过法律途径解决纠纷。

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