村里合资建房协议书的有效性取决于多个因素，若满足一定条件，则协议有效；反之，则可能无效。以下是对这一问题的详细分析：
协议有效的条件
符合法律法规和政策规定：
- 协议内容必须不违反《中华人民共和国土地管理法》《中华人民共和国城乡规划法》等法律法规的强制性规定。例如，不得擅自改变土地用途，将农用地用于非农业建设；必须依法办理用地审批、规划许可等手续。
- 协议应符合当地农村建设规划和政策要求，确保建设活动的合法性。
当事人具有相应的民事行为能力和真实意思表示：
- 参与合资建房的各方当事人，包括村集体组织、村民及合作方，必须具备相应的民事行为能力，能够独立承担民事责任。
- 各方签订协议的意思表示必须真实，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。
经过合法程序决策：
- 农村集体事务需按照民主程序进行决策。合资建房协议应经村集体成员大会或成员代表大会等法定程序讨论通过，以确保协议的合法性和有效性。
主体适格：
- 合资建房的主体需具备相应的资质和资格。例如，与村集体合作建房的企业应具备相应的建设资质。
- 宅基地是农村集体所有的土地，只有本村集体经济组织的成员才有资格申请使用。因此，合资建房的双方应至少有一方为本村村民，或协议应经过相关部门审批并取得合法的建设手续。
协议可能无效的情形
违反土地管理规定：
- 如果合资建房协议涉及擅自改变土地用途，将农用地用于非农业建设，或未经过合法的审批程序占用集体土地进行建房，协议将被认定为无效。
未经合法程序决策：
- 如合资建房协议未经村集体成员大会或成员代表大会等法定程序讨论通过，损害了村集体成员的合法权益，协议可能被认定无效。
主体不适格：
- 如果合资建房的一方或多方不具备相应的主体资格，如企业无建设资质、非本村村民参与等，协议可能因主体不适格而无效。
存在其他违法行为：
- 如协议存在欺诈、胁迫、损害社会公共利益等其他违法情况，也将导致协议无效。
实际应用中的建议
完善前置程序：
- 在签订合资建房协议前，应提前向乡镇政府申请乡村建设规划许可，完成农用地转用审批（如需）。
- 通过村民会议或代表会议形成书面决议，留存备查，以确保决策程序的合法性。
规范协议条款：
- 协议应明确出资方式、产权分配、违约责任等核心条款，避免模糊不清或遗漏重要内容。
- 建议由专业律师审核把关协议条款，以确保协议的合法性和有效性。
及时登记确权：
- 建设完成后，应依法办理不动产登记，明确产权归属，避免因权属不清引发后续纠纷。
举例说明：假设某村集体与一家建筑企业签订合资建房协议，计划在村集体土地上建设住宅楼。若该协议未经村集体成员大会讨论通过，且建筑企业未取得相应的建设资质，同时协议中未明确产权分配和违约责任等核心条款，那么该协议很可能因违反合法程序决策、主体不适格以及条款不明确而被认定无效。
综上所述，村里合资建房协议书的有效性取决于多个因素。为确保协议的合法性和有效性，建议在签订前咨询专业律师，并严格按照相关法律法规和政策要求进行决策和审批程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。