二类事业单位以报销加班工作餐费套取办公经费的行为属于违法违规行为，可能涉及行政责任、纪律责任甚至刑事责任，具体追究方式需根据行为性质、情节严重程度及造成的后果综合判断。以下从不同法律角度展开分析：
1. 行政责任：违反财政资金管理规定
根据《财政违法行为处罚处分条例》第六条，单位以虚报、冒领等手段骗取财政资金的，责令改正，调整有关会计账目，追回被骗取的财政资金，并对单位处以被骗取金额10%-50%的罚款；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处以3000元以上5万元以下的罚款。
关键点：
- 需证明“套取”行为存在（如虚构加班记录、伪造餐费发票等）；
- 行政处罚由财政部门或上级主管部门作出，单位需配合调查并整改。
2. 纪律责任：违反事业单位人员管理规定
若行为涉及事业单位工作人员，可能违反《事业单位工作人员处分暂行规定》第十七条，利用职务之便骗取公共财物，情节较轻的给予警告或记过处分；情节较重的给予降低岗位等级或撤职处分；情节严重的给予开除处分。
关键点：
- 需区分单位行为与个人行为（如是否为个人主导或参与）；
- 纪律处分由事业单位或主管部门作出，需依程序调查取证。
3. 刑事责任：可能构成贪污罪或诈骗罪
- 贪污罪（《刑法》第三百八十二条）：若行为人具有国家工作人员身份（如事业单位在编人员），利用职务便利套取公款归个人所有，数额达到3万元以上，可能构成贪污罪，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大或情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金或没收财产。
- 诈骗罪（《刑法》第二百六十六条）：若行为人以非法占有为目的，虚构事实骗取公款，数额达到3000元至1万元以上（各地标准不同），可能构成诈骗罪，处三年以下有期徒刑、拘役或管制，并处或单处罚金。
关键点：
- 需证明行为人具有非法占有目的（如将套取资金用于个人消费而非单位开支）；
- 刑事立案由公安机关经侦部门或监察委员会调查，需严格证据标准。
4. 其他法律后果
- 审计整改：若行为被审计部门发现，需按《审计法》规定限期整改，并可能被通报批评；
- 信用惩戒：单位或个人可能被纳入财政资金管理“黑名单”，影响后续资金申请或项目审批。
建议行动方向
- 内部自查：单位应立即停止违规行为，核查财务账目，主动退还套取资金；
- 配合调查：若已被相关部门立案调查，需积极配合提供证据，争取从轻处理；
- 法律救济：若对处罚决定不服，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
提示：具体责任需结合行为细节（如套取金额、参与人员、资金用途等）综合判断，建议携带相关材料进一步咨询以制定应对方案。