关于您提出的“不在公司上班公司给交保险是否合法”的问题，这主要取决于双方是否存在真实的劳动关系或是否有合法的特殊安排。以下是我为您详细梳理的解答：
一、合法情形
劳动关系存续但暂时离岗：
- 如果您与公司之间仍然保持着劳动关系，只是因为某些合法合理的原因（如病假、产假、工伤停工留薪期等）暂时不在公司上班，那么公司是有义务继续为您缴纳社保的。这是公司依法应尽的责任，旨在保障您在特殊时期的社保权益。
双方协商一致的特殊安排：
- 在某些情况下，即使您已经离职或即将离职，但与公司经过充分沟通并达成一致意见，公司出于自愿且基于合理理由（如新单位社保缴纳有时间衔接问题）继续为您缴纳社保，并签订了相关协议明确权利义务，这种情况下公司缴纳社保也是合法的。不过，通常这种情况下，社保费用会由您个人承担或双方按约定分担。
劳动关系已建立但未正式上班：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。这意味着，即使您还未正式开始工作，但如果已经与用人单位签订了劳动合同或存在事实劳动关系，用人单位为您缴纳社会保险是合法的。
二、不合法情形
虚构劳动关系缴纳社保：
- 如果您实际上已经与公司解除了劳动关系，不存在真实的劳动用工关系，但公司却为您缴纳社保（如为了帮助您获取购房、购车资格或骗取社保待遇等），这种通过虚构劳动关系来缴纳社保的行为是违法的。一旦被社保部门查处，公司可能面临罚款等处罚；涉及骗取社保待遇的，还可能面临更严厉的法律制裁。
利用挂靠方式缴纳社保：
- 如果您与公司不存在真实劳动关系，只是向公司支付一定费用，以公司名义缴纳社保，这种行为也是不合法的。它扰乱了社保管理秩序，可能损害社保基金的安全。
三、法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第七十二条：明确规定了用人单位和劳动者必须依法参加社会保险，缴纳社会保险费。
- 《中华人民共和国社会保险法》第五十八条：要求用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。
四、建议
- 如果您与公司之间存在真实的劳动关系，且因合法合理原因暂时不在公司上班，公司应继续为您缴纳社保。
- 如果您已经离职或即将离职，但希望公司继续为您缴纳社保，建议与公司进行充分沟通并签订相关协议，明确权利义务和费用分担方式。
- 如果您发现公司存在虚构劳动关系或利用挂靠方式为您缴纳社保的违法行为，应及时向社保部门或劳动监察部门举报，以维护社保管理秩序和社保基金的安全。
综上所述，公司在员工不在职的情况下为其缴纳社保的合法性取决于具体情况。在存在真实劳动关系或合法协议的情况下，公司缴纳社保是合法的；而在虚构劳动关系或挂靠缴纳社保的情况下，则是违法的。希望以上解答能对您有所帮助。